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特殊染色法为了显示与确定组织或细胞中的正常结构或病理过程中出现的异常物质、病变及病原体等，需要分别选用相应的显示这些成分的染色方法进行染色。包括：胶原纤维染色（Masson等）、网状纤维染色、弹力纤维染色、肌肉组织染色（磷钨酸苏木素）、脂肪染色（苏丹Ⅲ）、糖原染色（PAS）、粘液染色（PAS）等。
相关染液：苏丹Ⅲ、Ⅳ，甲苯胺蓝。
病理诊断：***硬化性疾病的观察。 缓冲亚甲蓝法：将尼氏体及核仁和背景双重染色；尼氏体及核仁蓝色，背景红色或粉红色。河北双色染色评价
四川扬克斯特为您介绍病原微生物染色。
***和霉菌：***引起的病变虽然多种多样，但都不具有特异性，且***在HE染色中均显蓝色，故须作***染色。
应用：
在化脓性炎、坏死性化脓性炎及肉芽组织性化脓性炎或化脓性炎伴有巨细胞反应疑为霉菌***时，找到霉菌的菌丝、抱子及菌体即诊断为霉菌性炎。
细菌： 细菌在HE染色上不能分类，故须作细菌染色。
（1）一些疑为细菌***性炎症，可用细菌染色进一步确定病原诊断。如伤寒肉芽肿性炎或葡萄球菌性炎等化脓性炎症的诊断中细菌染色有很重要的诊断价值。
（2）风病与结核病：均由菌体表面含蜡质膜的抗酸杆菌所***形成，故须经抗酸染色才能着色，从而与其它疾病相鉴别。
青海单色染色结果苦味酸-酸性品红法 胶原纤维，肌纤维、细胞质双重染色；胶原纤维红色，肌纤维和红细胞黄色，细胞核蓝褐色。
显示胶原纤维、网状纤维和弹力纤维的三联染色法的染色步骤：
(1)中性甲醛液固定组织，石蜡切片，常规脱蜡至水。
(2)高锰酸钾硫酸液氧化3min后，自来水浸洗后，用2%草酸漂白2min.
(3)5%硫酸铁铵1min.
(4)Gomori氨性银改良液染1min.
(5)蒸馏水洗2次，用15%甲醛液还原1min.
(6)蒸馏水洗2次，氯化金30s，蒸馏水洗1次。
(7)70%乙醇浸一次，再浸入维多利亚蓝液中染30min-1h.
(8)95%乙醇分化1min左右。
(9)浸入蒸馏水中1min后，用丽春红S染色液染色2min.
(10)直接用无水乙醇脱水，二甲苯透明，中性树胶封固。
3.结果
胶原纤维呈红色，网状纤维呈黑色，弹力纤维呈绿色，肌肉和红细胞呈淡黄色。
4.注意事项
氨性银液滴染时，要用干净吸管，防止银液污染而发生沉淀。氨性银液作用后的切片不能倾倒，应将蒸馏水冲洗切片上的银液，这样就不会使银液表面的银挥发.
颗粒而沉积在组织上。
实验室常用人工染料（4）结晶紫：
结晶紫是碱性染料，能溶于水(溶解度9%)和酒精(溶解度8.75%)。结晶紫在细胞学、组织学和细菌学等方面应用极广，是一种优良的染色剂。他是细胞核染色常用的，用来显示染色体的中心体，并可染淀粉、纤维蛋白、神经胶质等。凡是用番红和苏木精或其他染料染细胞核不能成功时，用它能得到良好的结果。用番红和结晶紫作染色体的二重染色，染色体染成红色，纺锤丝染成紫色，所以也是一种显示细胞分裂的优良染色剂。用结晶紫染纤毛，效果也很好。用结晶紫染色的切片，缺点是不易长久保存。
龙胆紫：
龙胆紫是混合的碱性染料，主要是结晶紫和甲基紫的混合物。在必要是，龙胆紫能跟结晶紫互相替用。医药上用的紫***，主要成分是甲基紫，需要时能代替龙胆紫和结晶紫。 中文名：特殊染色，应用：***硬化性疾病的观察，包括：网状纤维染色、弹力纤维染色等。
植物细胞壁染色剂：配方一、纤维素细胞壁染液(Ⅰ)取固绿，溶于100毫升95%酒精中，即成。该液能染色纤维素细胞壁，还用于动植物中作浆质染色剂。配方二、纤维素细胞壁染液(Ⅱ)氯化锌20克碘化钾碘先把氯化锌溶于少量蒸馏水中，再加入，即成碘-氯化锌溶液。该染液能把细胞壁染成紫色，胞质染成淡黄色，胞核染成棕色。配方三、纤维素细胞壁染液(Ⅲ)甲液：取1克碘和，溶于100毫升蒸馏水中，即成1%碘液。乙液：取7份硫酸和3份蒸馏水相混，即成665%硫酸溶液。染色时，在材料上滴加甲液，再加一滴乙液，纤维素细胞壁就染成黄色。配方四、木质化细胞壁染液(Ⅰ)硫酸化苯胺（或盐酸化苯胺）1份蒸馏水70份95%酒精30份、硫酸30份将上述各组分相混，将细胞材料放入混合液里染色，可是木质化细胞壁呈鲜黄或姜黄色。配方五、木质化细胞壁染液(Ⅱ)取间**4~5克，溶于100毫升95%酒精中，即成间**-酒**。先在材料.上滴上1滴浓盐酸，然后滴上间**一酒**1滴，木质化的细胞壁就染上樱红或紫红色。配方六、木质化细胞壁染液(Ⅲ)取1克番红，溶于99毫升蒸馏水中，即成1%番红溶液。 HE染色的适用范围:组织学、胚胎学、病理学教学与科研。陕西阿利新蓝染色试剂
甲醇刚果红法：将淀粉样物，细胞核双重染色；淀粉样物紫红色，细胞核蓝色。河北双色染色评价
四川扬克斯特为您介绍多色染色法示例：
（1）一、Mallory三色染色法（染结缔组织）
1.试剂配制
(1)重铬酸钾液
重铬酸钾2.5g;醋酸5m1，蒸馏水95ml
(2)苯胺蓝桔黄G液苯胺蓝0.5g，桔黄G2g，磷钨酸1g，蒸馏水100m1
(3)酸性复红液酸性复红0.5g，蒸馏水100ml
2.染色步骤
(1)中性甲醛液固定组织，石蜡切片，常规脱蜡至水。
(2)重铬酸钾液10mino
(3)蒸馏水冲洗2min，蒸馏水2次。
(4)酸性复红液2min,蒸馏稍洗。
(5)苯胺蓝液20min,95%乙醇快速分化。
(6)直接用无水乙醇脱水，二甲苯透明，中性树胶封固。
3.结果
胶原和网状纤维呈蓝色，软骨、粘液、淀粉样变物质呈淡蓝色:神经胶质纤维、
肌纤维和酸性颗粒呈红色，髓鞘和红色呈桔红色。
4.注意事项
(1)酸性复红液易溶解于水，肉眼观察切片上保留一定的红色。
(2)苯胺蓝液染色后，用95%乙醇分化时，须用显微镜观察掌握。
(3)对陈旧的固定标本，其染色效果较差，可增加染色时间。
(4)另张切片，可同时作胶原纤维对照染色而进行鉴别组织成分。 河北双色染色评价
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