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特殊染色法为了显示与确定组织或细胞中的正常结构或病理过程中出现的异常物质、病变及病原体等，需要分别选用相应的显示这些成分的染色方法进行染色。包括：胶原纤维染色（Masson等）、网状纤维染色、弹力纤维染色、肌肉组织染色（磷钨酸苏木素）、脂肪染色（苏丹Ⅲ）、糖原染色（PAS）、粘液染色（PAS）等。
相关染液：苏丹Ⅲ、Ⅳ，甲苯胺蓝。
病理诊断：***硬化性疾病的观察。 硝酸银染色法：将胃幽门螺杆菌染色；胃幽门螺杆菌棕黑或黑色，背景淡黄色。陕西单色染色方法
植物相关常用染色方法（1）：(1)淀粉类：淀粉是植物的主要贮藏物质，它们在各种不同的植物细胞中形成各种形状小同的颗粒。由于碘与淀粉作用可形成碘化淀粉而呈蓝色反应，用碘－碘化钾溶液来测试淀粉粒已成为**常用的方法。(2)蛋白质类：植物细胞中的蛋白质是构成原生质体的主要成分，也可成为后含物贮存于细胞内，可能是无定形的，也可能成为结晶体或成为糊粉粒。①较普遍的方法是用碘化钾染色，显微镜下观察可看到被染成黄色的圆球状小颗粒，即为储藏蛋白质的糊粉粒。②**－溴酚蓝法是检测糊粉粒的**普通方法：在切片上滴加**－溴酚蓝试剂（**10g,溴酚蓝1mg,蒸馏水100ml)1滴，过5分钟后，用，除去切片上多余的染料，再放在培养皿中水洗5分后用甘油封藏，细胞中如有糊粉粒则被染成鲜蓝色。③曙红－酒精－苦味酸法也是显示糊粉粒的较好方法：在切片上滴上曙红－酒精－苦味酸试剂（配方曙红1g,溶于苦味酸的95%酒精饱和溶液50ml),镜检，当糊粉粒的基质现出蓝色时，加上数滴纯酒精，此时糊粉粒中球蛋白无色而结晶现出黄绿色，吸去多余酒精，用丁香油透明，加拿大树胶封固，**终蛋白质结晶应为黄色，球蛋白为粉红色，基质为暗红色。 昆明番红固绿染色切片甲醇刚果红法：将淀粉样物，细胞核双重染色；淀粉样物紫红色，细胞核蓝色。
显示胶原纤维、网状纤维和弹力纤维的三联染色法的染色步骤：
(1)中性甲醛液固定组织，石蜡切片，常规脱蜡至水。
(2)高锰酸钾硫酸液氧化3min后，自来水浸洗后，用2%草酸漂白2min.
(3)5%硫酸铁铵1min.
(4)Gomori氨性银改良液染1min.
(5)蒸馏水洗2次，用15%甲醛液还原1min.
(6)蒸馏水洗2次，氯化金30s，蒸馏水洗1次。
(7)70%乙醇浸一次，再浸入维多利亚蓝液中染30min-1h.
(8)95%乙醇分化1min左右。
(9)浸入蒸馏水中1min后，用丽春红S染色液染色2min.
(10)直接用无水乙醇脱水，二甲苯透明，中性树胶封固。
3.结果
胶原纤维呈红色，网状纤维呈黑色，弹力纤维呈绿色，肌肉和红细胞呈淡黄色。
4.注意事项
氨性银液滴染时，要用干净吸管，防止银液污染而发生沉淀。氨性银液作用后的切片不能倾倒，应将蒸馏水冲洗切片上的银液，这样就不会使银液表面的银挥发.
颗粒而沉积在组织上。
实验室常用天然染料1、苏木精苏木精是从南美的苏木（热带豆科植物）干枝中用**浸制出来的一种色素，是**常用的染料之一。苏木精不能直接染色，必须暴露在通气的地方，使他变成氧化苏木精（又叫苏木素）后才能使用，这叫做“成熟”。苏木精的“成熟”过程需时较长，配置后时间愈久，染色力愈强。被染材料必须经金属盐作媒剂作用后才有着色力。所以在配制苏木精染剂时都要用媒染剂。常用的媒染剂有硫酸铝按、钾明矾和铁明矾等。苏木精是淡黄色到锈紫色的结晶体，易溶于酒精，微溶于水和甘油，是染细胞核的优良材料，他能把细胞中不同的结构分化出各种不同的颜色。分化时组织所染的颜色因处理的情况而异，用酸性溶液(如盐酸-酒精)分化后呈红色，水洗后仍恢复青蓝色，用碱性溶液(如氨水)分化后呈蓝色，水洗后呈蓝黑色。2、洋红洋红又叫胭脂红或卡红。一种热带产的雌性胭脂虫干燥后，磨成粉末，提取出虫红，再用明矾处理，除去其中杂质，就制成洋红。单纯的洋红不能染色，要经酸性或碱性溶液溶解后才能染色。常用的酸性溶液有冰醋酸或苦味酸，碱性溶液有氨水、硼砂等。洋红使细胞核的优良染料，染色的标本不易褪色。用作切片或组织块染都适宜，尤其适宜于小型材料的整体染色。 油红O脂肪法是显示组织内脂肪的染色方法，染料在脂肪内能高度溶解，可特异性的使组织内的中性脂肪着色。
显示胶原纤维、网状纤维和弹力纤维的三联染色法的试剂配制：
(1)高锰酸钾硫酸液高锰酸钾水溶液中加入5ml的硫酸。
(2)维多利亚蓝染色液维多利亚蓝2g，糊精0.5g，间苯二酚4g；蒸馏水200ml。
将上述物质混合后加热煮沸，边煮边搅拌，约5min。然后用另一容器取30%三氯化铁水溶液25ml，另行加热煮沸后慢慢倒入上述混合液中继续煮沸3min,不断搅拌溶液呈胶体状。去火冷却过滤，将滤纸上的残渣连同滤纸放在60℃恒温箱中烤干。残渣呈深蓝色细颗粒状粉末，再溶于400ml的70%乙醇液中。然后加浓盐酸4ml和苯酚5g放置至成熟后使用。
(3)丽春红染色S染色液
丽春红S水溶液15ml，苦味酸饱和水溶液85ml。
(4)Gomori氨性银改良液取5%硝酸银水溶液5ml，滴加浓氨水由棕黑色变清为止，再加入3%氢氧化钠水溶液5ml，此时该液突变紫黑色，这时再加入氨水使之变清晰为止。***用蒸馏水补足至50ml，盛棕色试剂瓶中，置于冰箱中备用较长时间。 地依红染色法：将弹力纤维、结缔组织，细胞核双重染色；弹力纤维呈深棕色，结缔组织浅棕色，细胞核蓝色。青海天狼星红染色效果
苏木精染液为碱性，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核酸着紫蓝色。陕西单色染色方法
植物相关常用染色方法（2）：油脂：在植物解剖学研究中，常用苏丹Ⅲ（或苏丹 IV) 溶液对脂肪性物质进行染色切片浸入上述溶液中 24h, 然后用 50% 的酒精洗涤，加上甘油后观察，油脂可被染成淡黄至红色，栓质和角质也同样被染色。如果细胞中存在硬脂或脂肪酸结晶时，染色十分缓慢，可稍加热。
单宁：单宁的化学结构比较复杂，它是一种多元酚的衍生物，大多呈胶体状态，存在于植物细胞的液泡中，或形成单独的液泡。将切片浸人 10% 的氯化铁水溶液中（或加－些碳酸钠），单宁物质则被染成蓝绿色。
橡胶：天然橡胶是异戊二烯的聚合物，植物组织中所含橡胶物质大多存在千乳汁管中，也有的存在于液泡中。对存在于乳汁管中的橡胶成分，可以用苏丹Ⅲ溶液染色材料应先用 10%铬酸 +70%酒精（使用前配制）固定 24h, 以使橡胶凝固，用刀片切去1-2mm, 而后徒手切片，于载玻片上加上苏丹Ⅲ或苏丹 Ⅳ溶液染色，乳汁管中的橡胶类物质被染成红色。 陕西单色染色方法
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