在质粒DNA提取过程中,确保DNA的完整性和活性至关重要,这通常涉及以下几个关键因素:1.**温和的裂解条件**:选择适当的裂解方法对于保持DNA的完整性至关重要。对于大于15kb的质粒DNA,应采用温和的裂解方法,如将细菌悬浮于等渗的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破坏细胞壁和细胞膜,以减少对质粒DNA的机械剪切力,从而保护其完整性。2.**避免过度裂解**:在质粒提取过程中,并非裂解时间越长越好。过长的裂解时间可能会造成基因组DNA片段的污染,影响质粒的纯度。3.**适当的洗涤和洗脱**:在纯化过程中,适当的洗涤可以去除蛋白质和其他杂质,但过度洗涤可能会导致DNA的损失。洗脱步骤中,确保洗脱液完全浸润柱膜,以保证结合在柱膜上的质粒得以充分洗脱,避免因洗脱体积过小而影响质粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取过程中,添加核酸酶抑制剂可以防止DNA被核酸酶降解。同时,避免长时间将DNA暴露在室温下,以及避免多次冻融循环,这些都有助于保护DNA的完整性。5.**低温操作**:尽量在低温条件下进行提取操作,以减少核酸酶的活性,从而保护DNA的完整性。

嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)和它的大片段(LargeFragment)是两种在分子生物学实验中常用的酶。它们的主要区别在于结构和活性:1.**结构**:-完整的BstDNAPolymeraseI包含一个5'→3'的核酸外切酶活性区域,而大片段是通过基因工程改造或蛋白酶处理去掉了这个外切酶活性区域的酶。因此,大片段没有5'→3'的核酸外切酶活性,但保留了5'→3'的DNA聚合酶活性。2.**活性**:-BstDNAPolymeraseI具有5'→3'的核酸外切酶活性,这意味着它在合成DNA的同时可以“校对”错误,切除不匹配的核苷酸。而大片段由于缺少外切酶活性区域,不具有这种校对能力。-大片段具有更强的链置换能力,这使得它非常适合于等温扩增反应,如环介导的等温扩增(LAMP)和滚环扩增(RCA)。3.**应用**:-BstDNAPolymeraseI由于具有校对功能,可能更适合于需要高保真度的DNA合成反应。-BstDNAPolymerase,LargeFragment由于其链置换能力,更适合于等温扩增技术,这些技术不需要热循环仪,可以在恒定温度下进行DNA扩增。4.**热稳定性**:-BstDNAPolymerase,LargeFragment通常在65°C左右的温度下进行反应,而BstDNAPolymeraseI可能具有更宽的反应温度范围。Recombinant Human FGF-12泛素化蛋白随后被靶向到26S蛋白酶体进行降解,或出现蛋白位置或活性变化。

T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因编辑中的应用主要体现在突变体检测和基因编辑效率评估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具体应用步骤和特点:1.**基因编辑效率评估**:-T7EI用于评估CRISPR-Cas9在给定的导向RNA靶位点上对细胞群体进行基因编辑的效率。-通过PCR扩增围绕CRISPR导向RNA靶位点的基因组DNA,如果CRISPR-Cas9介导的非同源末端连接(NHEJ)修复事件引入了突变,变性和退火将形成突变型和野生型PCR扩增子的异源双链DNA。2.**突变体检测**:-如果CRISPR/Cas9编辑成功在DNA上引入突变,则可与野生型DNA片段退火产生异质双链DNA。T7EI可以识别该DNA上的不完全配对的DNA位点然后进行双链切割,通过琼脂糖凝胶电泳即可显示酶切后的条带,从而半定量判定基因编辑效果。-T7EI能识别长度大于或等于2bp的插入、缺失或突变导致的错配DNA,不能识别1bp的插入、缺失或突变。3.**实验步骤**:-收集细胞并提取基因组DNA,然后使用PCR扩增期望编辑的基因组区域。扩增子的长度建议为0.5-1kb。-对扩增的DNA进行变性和退火复性,以产生异质双链DNA。-使用T7EI酶处理退火后的DNA产物,在37℃孵育15分钟。
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端处理上的主要不同点如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,它从DNA链的3'-OH末端逐步切去单核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**底物特异性**:-**ExoIII**:适底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于双链DNA切刻位点产生单链缺口。由于对单链DNA无活性,因此难以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:适底物是5'磷酸化的双链DNA,对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**活性差异**:-**ExoIII**:对具有3'-突出末端(至少有4个碱基,且具有3'-末端C残基)的DNA、单链DNA、硫代磷酸酯连接的核苷酸无活性。-**Lambda核酸外切酶**:对5'-OH端的切割速度比5'-P端慢约20倍;对单链DNA的酶切速度比双链DNA慢约100倍。4.**应用场景**:-**ExoIII**:可以用于生产特定方向的单链DNA,将线性化DNA设计成为一端为不切割末端(3'突出端),另一端则设计为易切割末端(平端或5'突出端)。

T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特点和技术应用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解双链或单链DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能从单链或双链DNA的5'末端起始消化,也可以从线性或环状双链DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)处起始消化。3.**对超螺旋双链DNA的作用**:T5核酸外切酶无法降解超螺旋双链DNA。4.**单链DNA核酸内切酶活性**:T5核酸外切酶还具有单链DNA核酸内切酶活性。5.**应用领域**:-用于Gibson组装,这是一种在恒温条件下有效连接带有多个重叠序列片段的技术。-从完全连接的环状双链DNA中去除不完全连接产物。-降解碱裂解质粒提取方法中产生的变性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和转染效率。-降解质粒样品中污染的线性化和切刻DNA。6.**操作条件**:推荐在37℃温育30分钟,之后加入EDTA至终浓度为20mM终止反应。7.**储存条件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事项**:避免起泡或剧烈搅拌、涡旋等操作,以防止本品失活。这些特点和技术应用使得T5核酸外切酶在分子生物学实验中,尤其是在DNA克隆和基因片段组装中,具有重要的应用价值。Tn5转座酶高通量测序建库、ATAC-seq 等多种先进的分子生物学技术,能够与这些技术很好地结合。Recombinant Human ANXA1 Protein,His Tag
在某些糖蛋白的纯化方案中,利用 Endo H 对糖链的特异性水解作用,去除糖蛋白上的糖链。Recombinant Human ANXA1 Protein,His Tag
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
NTPSetSolution(脱氧核糖核苷三磷酸溶液套装)是分子生物学实验中不可或缺的基础试剂,包含四种高纯度的dNTP(dATP、dCTP、dTTP和dGTP),每种浓度均为100mM。这种高浓度的溶液套装为DNA合成提供了高质量的原料,广泛应用于PCR、DNA测序、克隆以及体外DNA合成等领域。产品特点dNTPSetSolution(100mMeach)提供了四种脱氧核苷三磷酸,每种浓度均为100mM,能够满足多种实验需求。这种高浓度设计不仅减少了实验中试剂的添加量,还降低了污染风险,同时便于实验人员根据具体需求进行稀释和使用。此外,该套装经过严格的质量控制,确保纯度和稳定性,能够为DNA...