胶原纤维染色：凡是间叶组织细胞都可产生网织纤维，也可产生胶原纤维，纤维母细胞是产生胶原纤维的主要细胞。胶原纤维是结缔组织中的主要纤维，是结缔组织中起支持作用的重要部分，具有一定的韧性和坚固性，能抵抗一定的牵引力而不致撕裂。胶原纤维是原胶原互相错开1/4平行排列交联成胶原原纤维，胶原原纤维再聚合成较宽的结构。按胶原的化学成分可分为15种，间质中的胶原纤维主要由I、Ⅱ、Ⅲ型胶原组成，新鲜时呈白色，故又称为白纤维。在HE染色中呈均一的粉红色，与周围间质区分不是很清楚。染色后，便可明显区别开来，易于观察病变时胶原纤维的变化。
应用：
（1）***硬化性疾病的观察：如肝硬变、心肌瘢痕的观察，胶原染色更易于观察诊断。
（2）瘢痕与淀粉样物质鉴别：前者胶原纤维染色为阳性，后者为阴性。
（3）骨纤维异常增殖病与骨纤维化的鉴别：利用胶原纤维染色可较易观察前者胶原纤维紊乱，纵横交错，后者较规则。 HE染色法是组织学、胚胎学、病理学教学与科研中**基本、使用*****的技术方法。黑龙江masson染色上机
实验室常用人工染料（3）苏丹II：
苏丹II是弱酸性染料，呈红色粉末状，易溶于脂肪和酒精(溶解度为0.15%)。 苏丹I是脂肪染色剂。
伊红：
这类染料种类很多。常用的伊红Y，是酸性染料，呈红色带蓝的小结晶或棕色粉末状，溶于水(15摄氏度是溶解度达44%)和酒精(溶于无水酒精的溶解度为2%)。伊红在动物制片中广泛应用，是很好的细胞质染料，常用作苏木精的衬染剂。
碱性品(复)红：
碱性品红是碱性染料,呈暗红色粉末或结晶状，能溶于水(溶解度1%)和酒精(溶解度8%)。碱性品红在生物学制片中用途很广，可用来染色胶原纤维、弹性纤维、嗜复红性颗粒和***组织的核质。在生物学制片中用来染维管束植物的木质化壁，又作为原球藻、轮藻的整体染色。在细菌学制片中，长用来鉴别结核杆菌。在尔根氏反应中用作组织化学试剂，已核查脱氧核糖核酸。 福建单色染色切片苏丹Ⅲ染色法：将脂肪和细胞核染色，遇脂肪变橘黄色，细胞核呈蓝色。
番红染液的运用特点：
番红通常具有红色成团的化学成像结构(有时被描述为二甲基番红)。同时也有三甲基番红，其在下环的邻位有多加一个甲基。这两个化合物在生物染色应用的表现基本上是相同的，所以大部分番红的制造商并无法区分这两者。商业用番红的配制经常会包含这两种类型的混合。
番红也在分析化学中被用作氧化还原指示剂。
番红是个在一分子中含有两个氮原子的化合物，其为对称的2,8-二甲基-3,7-二氨基吩嗪。可以借由连接一分子氧化的对位-二氨和两分子的一级氨取得。
这是透过对位-氨基偶氮与一级氨的浓缩以及对位-亚硝基二烷基苯胺和二级碱基，例如二苯基间苯二胺，之间的反应。它们为呈现出特有绿色金属光泽的结晶固体；在水中立即被溶解并能染成蓝色或紫色。
同时也是可形成稳定的一元酸盐类的强碱。它们的酒精溶液会显现出红黄色的萤光。酚藏红在自由态时十分不稳定；它的氯化物会形成绿色的板块。其很容易就重氮化，而重氮化的盐类与酒精煮沸后会产生阿朴藏红或引杜林染料，C18H12N3。
吸虫染色剂
梅耶氏(Mayer' s )明矾-洋红染液
取铵明矾(硫酸铝铵) 5克，溶于95毫升蒸馏水中，再加入0.5克洋红酸，加热溶解，冷却后过滤。在滤液中加入少量防腐剂，如麝香草酚、樟脑粉、水杨酸钠、苯酚(石炭酸)等，以防生霉。
这种染液适合于染小型动物材料，如吸虫等寄生虫的整体，也能染高等植物的表皮和蕨类植物的原叶体。
***染色剂
配方一、中性红染液.
先配成1%中性红水溶液(1克中性红溶于100毫升蒸馏水中)。取这种溶液1毫升，用0.6%生理盐水(或蒸馏水)稀释到50毫升，即成0.02%中性红水溶液，贮存在棕色瓶里，放在黑暗处。
本染液用来显示原生动物的食物泡以及动植物组织中活细胞的内含物等。
配方二、尼罗蓝(Nile Blue)染液
取0.1克尼罗蓝，溶解于1000~1500毫升蒸馏水中，即成尼罗蓝染液。
这种染液能把原生动物大核染成绿色，食物泡染成蓝色。
配方三、亚甲蓝染液
取0.1克亚甲蓝，溶解于1000毫升蒸馏水中，即成亚甲蓝染液。
这种染液用于原生动物的***染色。 苏木精染液为碱性，主要使细胞核内的染色质与胞质内的核酸着紫蓝色。
HE染色的试剂与仪器A：0.5~1%的伊红酒精溶液：
称取伊红Y0.5~1g，加少量蒸馏水溶解后，再滴加冰醋酸直至浆糊状。以滤纸过滤，将滤渣在烘箱中烤干后，以95%酒精（即工业酒精，如果不怕浪费，用无水乙醇配制也可）100毫升溶解。
B：苏木素染液配方：(配制3000ml，可按比列减少)
苏木精6g
无水乙醇100ml
硫酸铝钾150g
蒸馏水2000ml
碘酸钠1.2g
冰醋酸120ml
甘油900ml
配制方法：将苏木素溶于无水乙醇，再将硫酸铝钾溶于蒸馏水，溶解后将甘油倾入一起混合，***加入冰醋酸和碘酸钠。
C：1%盐酸酒精分化液：将1毫升浓盐酸加入99毫升70%酒精中即可。 地衣红法：将HBsAg染色；HBsAg阳性呈棕色。江西荧光染色质量
masson染色是指用两种或三种阴离子染料混合，胶原纤维呈蓝色，肌纤维呈红色。黑龙江masson染色上机
席夫(Schiff's)试剂：
称取0.5克碱性品红，加到100 毫升煮沸的蒸馏水中，再微微加热5分钟，不断搅拌，使它溶解。在溶液冷却到50摄氏度时过滤，滤液中加入10毫升1N盐酸。再冷却到25摄氏度时加入0.5克偏重(亚硫酸钠)或无(水亚硫酸氢钠)。把溶液装入棕色试剂瓶内，摇荡后，塞紧瓶塞，放在黑暗中24小时。在溶液颜色退到淡黄色时，加入0.5克活性炭，用力摇荡1分钟，过滤后把滤液贮在棕色试剂瓶内，塞紧瓶塞，滤液应该是无色的。在使用时勿让溶液长时间暴露在空气中和见光(瓶外用黑纸或暗盒遮光)。
如溶液变成红色，即失去染色能力。碱性品红是较强的核染色剂，在孚尔根氏(Feulgen's)反应中作为组织化学试剂，以检查DNA。 黑龙江masson染色上机
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