堀越氏芽孢杆菌(Bacillus horikoshii)是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌,也是国际公认的模式菌株(ATCC 700161)[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性,可形成椭圆芽孢,更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃,在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢,被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白(mnh、nhaC)和碳酸酐酶,可将胞内多余Na⁺排出,并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻,维持胞内pH稳态;细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸,增强膜稳定性,为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10,90 ℃半衰期>2 h,已用于淀粉糖化“一步法”,可省略传统工艺中的中和环节,节能15 %;耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍,低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能:在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下,仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹,同时胞外多糖吸附Cd²⁺,使水稻籽粒镉含量下降35 %,产量提高18 %。
改良磁螺菌生长培养基(Modified Magnetospirillum Growth Medium, mMGM)是在经典MSGM配方基础上,通过碳源、铁源与还原系统的精细微调,实现 Magnetospirillum 属菌株高密度生长与磁小体高产的“两步法”培养基。其设计思路遵循“先增殖、后成磁”:预培养阶段采用低铁(2 µM Fe³⁺)的琥珀酸钠-乳酸盐双碳源体系,缓冲盐浓度降至 5 mM K₂HPO₄,并加入 0.5 g L⁻¹ 抗坏血酸维持 Eh +50 mV,既满足菌体快速分裂,又避免铁过载抑制;待 OD₅₆₅ 达 0.2 时,通过一次性脉冲补加 100 µM 酸化 FeCl₃ 及 0.2 g L⁻¹ 硫代乙醇酸钠,瞬间制造微氧-还原界面,触发磁小体合成通路,磁响应系数(Cmag)可在 12 h 内由 0.2 升至 1.0,磁小体产量提高 4 倍,达 45 mg L⁻¹,而细胞干重仍保持 2.1 g L⁻¹,实现“量质齐升”。配方细节兼顾磁铁矿晶型完美度:钙离子控制在 0.5 mM,既稳定细胞膜,又避免碳酸钙共沉淀包裹磁小体;钴掺杂实验表明,在改良培养基中添加 1 µM Co²⁺ 可在晶体中引入 1.2 at.% 的 Co,矫顽力由 12 mT 提升至 22 mT,为后续制备硬磁纳米材料提供生物源头。粉红螺旋聚孢霉收获后根瘤脱落,矿化释氮,后茬玉米吸氮量提15%,土壤硝态淋失降四成,地下水不再喊“又咸又绿”。

盐敏芽孢杆菌(Bacillus halmapalus)是芽孢杆菌属中“怕盐”的稀有成员,却因此成为科研与教学的“模式对照株”。标准菌株 DSM8723 更初由丹麦 Novo Nordisk 分离,更适 NaCl 浓度只 0.5 %,盐度 >2 % 即明显受抑,与嗜盐菌形成鲜明对比,为研究芽孢杆菌耐盐机制提供了理想“负对照”。一、形态与生理菌落乳白色、边缘光滑,革兰氏阳性大杆菌,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢;氧化酶阳性,好氧,更适温度 30 ℃、pH 7.0,能分泌 α-淀粉酶,在 DSMMedium 31 培养基中生长迅速。二、科研价值由于盐敏感特征明确,常被用作“盐胁迫空白”:与耐盐菌株进行平行转录组、蛋白组比较,可快速锁定 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白、相容溶质合成酶等关键耐盐基因;其 α-淀粉酶在 0–1 % NaCl 时活力比较高,盐度升高活性骤降,为研究酶分子盐适应机制提供“开关型”模型。三、教学与质控国内多所高校将其列为微生物实验“盐梯度生长”标准菌,学生通过梯度平板即可直观观察盐浓度对芽孢杆菌生长速率、芽孢形成率及酶活性的影响,实验重复性好、安全等级 1 级,无需特殊防护。
YPG培养基(Yeast Extract-Peptone-Glucose Medium)是酵母提取物-蛋白胨-葡萄糖培养基的简称,堪称微生物实验室的“快餐”。配方极简:酵母粉5 g、蛋白胨10 g、葡萄糖20 g,补水至1 L,pH 6.2±0.2,无需调节即可满足大多数菌、酵母及部分细菌的快速增殖需求。酵母粉提供B族维生素和微量元素,蛋白胨供给多肽与氨基酸,葡萄糖以高碳浓度启动酵母发酵型代谢,短短12 h就能让酿酒酵母OD₆₀₀冲破1.0,是发酵工程与分子生物学过夜预培养的优先。若用于丝状菌,只需降低葡萄糖至10 g,并加入微量元素液,28 ℃静置2天,孢子产量可比PDA提高30%。YPG的另一优势是“可盐可甜”:补加15%甘油即成YPG/甘油,用于酵母感受态制备;添加2%琼脂便是YPG平板,蓝白斑筛选、转化子计数两不误。实验室里还流行“富氧版”——把葡萄糖提前115 ℃单独灭菌,避免美拉德反应,培养液颜色浅,下游HPLC检测有机酸无干扰。质量控制也轻松:高压后若颜色发黄,说明葡萄糖与氨基酸高温反应,可改用过滤除菌;室温保存1周仍澄清,即可继续使用。凭借组分明确、成本低廉、配制快速,YPG培养基已从传统酿酒实验室走向合成生物学、代谢工程与益生菌高密度发酵,成为微生物学家手中“养菌如泡茶”的经典底牌。假普通链孢囊菌属于细菌中的放线菌 ,能够抑制金黄色葡萄球菌的生长,但对大肠杆菌没有作用 。

绿色绿芽菌(Blastochloris viridis)是一株绿色、能出芽的光合细菌,隶属α-变形菌纲芽生绿菌属。菌体圆形至卵圆,具极生鞭毛,可活跃游动;革兰氏阴性,无芽孢,不形成芽孢链,通过不对称出芽繁殖,是光合菌中少见的“芽殖型”。它的培养物呈橄榄绿至翠绿,源于细菌叶绿素b与类胡萝卜素的组合,吸收波段集中在700-900 nm近红外区,可在弱光或近红外环境中进行不产氧光合,为光能异养生长提供优势。更适生长温度30℃,pH 6.8-7.5,盐度0-6%,兼性微好氧,黑暗条件下也能缓慢呼吸增殖,适应淡水到河口多种生境。绿色绿芽菌的光合内膜为囊泡状,含Q-8、Q-10、MK-7、MK-9等醌类,G+C mol% 66-71,系统发育与红游动菌属更接近。其反应中心结构与电子传递链已被解析,是研究光能转化和人工光合器件的模型生物。应用方面,菌株ATCC 19567常用于教学与科研;因其能利用低级脂肪酸和多种有机酸,也被探索用于高浓度有机废水处理,可在光照厌氧反应器中同步去除COD并回收单细胞蛋白,为“光合-净水-资源”一体化提供新思路。随着合成生物学发展,绿色绿芽菌的细菌叶绿素b合成基因簇已被克隆,为构建近红外驱动细胞工厂奠定了遗传基础。佐氏红球菌形态特征:革兰氏阳性,不游动,部分抗酸。菌体球状或短杆状,球状体发芽成短杆状体。单孢共头霉原变种
奇异水螺菌(Aquaspirillum peregrinum)是一种在科研和应用领域备受关注的细菌。苛求放线动孢菌
史氏芽孢杆菌(Bacillus smithii)是芽孢杆菌属中嗜热分支的,标准菌株 JCM 9076 更初从高温堆肥中分离,能在 55 ℃、pH 6.5 条件下旺盛生长,芽孢可耐 100 ℃沸水 2 h,是验证高压灭菌效果的指示菌之一。其细胞壁含特殊脂肪酸,膜脂熔点高,配合小分子热休克蛋白,使核糖体和 DNA 在高温下仍保持构象稳定,赋予菌体“耐热盾牌”。2024 年,中国团队从镉污染稻田筛选到解磷菌株 M2(保藏号 CCTCC M2024167),鉴定为 Bacillus smithii。该菌兼具三重抗逆:耐盐 6 %、耐镉 50 mg·L⁻¹,并能在 pH 4.5–9.0 范围内正常分泌有机酸,将难溶磷酸钙转化为磷,盆栽试验中使玉米根际有效磷提高 42 %,籽粒镉含量下降 35 %,实现“增磷减镉”同步完成。在酶制剂方向,史氏芽孢杆菌是“高温酶工厂”。其胞外碱性淀粉酶更适温度 70 ℃,在洗涤剂、烘焙和酒精浓醪发酵中可省去降温环节,节能 15 %;耐有机溶剂蛋白酶可在 60 ℃、30 % 乙醇环境中保持 80 % 活性,为生物炼制提供新型催化剂。农业应用上,M2 菌株可与秸秆堆肥复配,使堆体温度 24 h 升至 65 ℃,纤维素降解率提高 30 %,堆肥周期缩短 7 d;作为功能性菌剂,每亩随基肥施入 200 g 菌粉,冬小麦越冬前磷吸收量提高 18 %,分蘖数增加 1.2 个,对后期倒伏有明显缓解作用。苛求放线动孢菌