提高SpCas9蛋白在基因编辑中的特异性和效率是CRISPR-Cas9技术发展的关键。根据新的研究进展,以下是一些提高SpCas9特异性和效率的策略:1.**工程化改造**:通过定向进化和蛋白工程的方法,研究人员可以对SpCas9进行改造,以提高其在细胞中的基因编辑活性。例如,JenniferDoudna团队开发的工程化iGeoCas9,通过在WED结构域引入突变,显著提高了基因编辑效率,比野生型GeoCas9高出100倍以上。2.**优化gRNA设计**:合理设计的gRNA可以提高Cas9的特异性,减少脱靶效应。研究人员通过生物信息学工具和实验验证,筛选出与目标DNA序列互补性更强且特异性更高的gRNA。3.**使用高保真Cas9变体**:研究人员开发了高保真Cas9变体,这些变体在保持编辑活性的同时,降低了脱靶风险。例如,通过突变Cas9蛋白的关键氨基酸残基,可以减少其在非目标位点的切割活性。4.**PAM序列的优化**:通过改变Cas9蛋白的PAM序列识别能力,可以扩大其靶向范围,从而提高编辑效率。例如,开发能够识别非典型PAM序列的Cas9变体。5.**递送系统的优化**:使用核糖核的蛋白(RNP)复合物的形式递送Cas9和gRNA,可以提高Cas9蛋白的稳定性和编辑效率。这种方法避免了mRNA或质粒递送可能引起的免疫反应。来源于 Thermococcus kodakaraensis,具有高热稳定性和校正能力,适用于长片段PCR和热启动PCR。Recombinant Mouse FAM3D Protein,hFc Tag
N末端His标签的泛素蛋白(RecombinantHumanUbiquitinProteinTagged-HisTag,UB)是一种经过遗传工程改造,在其N末端融合了His标签的泛素蛋白。以下是这种蛋白的一些特点:1.**His标签**:N末端His标签是一种常见的融合标签,用于提高蛋白质的可溶性和便于通过亲和层析进行纯化。His标签通常由6到10个组氨酸(His)组成。2.**重组表达**:这种泛素蛋白通常在大肠杆菌(E.coli)或其他宿主细胞中通过重组DNA技术表达。3.**高度保守**:泛素蛋白是一个76个氨基酸残基的多肽,在真核生物中高度保守。4.**分子量**:由于N末端添加了His标签,重组泛素蛋白的分子量会略大于天然泛素(约8.5kDa)。5.**纯度**:重组泛素蛋白通常具有高纯度(>95%bySDS-PAGE),适合用于各种生物化学和分子生物学实验。6.**溶解性**:His标签的添加可以提高蛋白质在水溶液中的溶解性,便于实验操作。7.**稳定性**:冻干粉形式的重组泛素蛋白在-25~-15℃保存,具有较长的有效期,通常为一年。8.**应用广**:N末端His标签的泛素蛋白可用于多种实验,包括蛋白质泛素化、E3泛素连接酶活性测定、蛋白质相互作用研究等。Recombinant Mouse GPA33/A33 Protein,His Tag在基因编辑中,Pfu DNA Polymerase 可用于目的基因或编辑工具的克隆,减少克隆过程中的非目标突变。
PNGaseF(肽-N-糖苷酶F)是一种普遍使用的酶,它可以从N-连接糖蛋白中去除几乎所有类型的N-连接糖链。其活性和稳定性可能会在不同的pH条件下发生变化。根据NEB(NewEnglandBiolabs)提供的PNGaseF产品信息,PNGaseF的好的活性和稳定性pH为7.5。在pH7.5时,PNGaseF的活性可以达到100%。然而,酶在不同温度下的活性表现也有所不同:在37°C时活性为100%,在30°C时也保持100%,而在23°C时活性下降到65%,17°C时为40%,在3°C时几乎无活性。这表明PNGaseF的活性随温度降低而下降,尽管pH值对酶活性有重要影响,但温度也同样是一个重要因素。此外,PNGaseF的活性会受到SDS的抑制,因此在变性条件下进行酶切时,反应混合物中必须包含NP-40,以1:1的比例存在,以抵消SDS的抑制作用。对于非变性条件下的酶切,可能需要更多的酶和更长的孵育时间。在实验操作中,为了确保PNGaseF的好的活性,建议按照制造商提供的推荐缓冲液和条件进行实验。如果需要在不同的pH条件下使用PNGaseF,可能需要通过实验优化来确定好的条件。
NLS-Cas9Nuclease是一种重组的化脓性链球菌Cas9蛋白,它在N端和C端都添加了核定位信号(NLS),这使得它能够更有效地进入细胞核并进行基因组编辑。这种蛋白与CRISPR/Cas9系统的引导RNA(gRNA)形成稳定的核糖核的蛋白(RNP)复合物,可以在进入细胞后立即定位到细胞核,从而诱导特定的DNA双链断裂,实现基因编辑。与传统的mRNA或质粒系统相比,使用NLS-Cas9Nuclease不需要转录和翻译过程,因此可以避免将外源DNA插入基因组的风险,这对于基因编辑尤其有用。NLS-Cas9Nuclease的特点包括:1.无DNA:系统不添加外部DNA,降低了插入外源DNA的风险。2.高切割效率:双NLS确保Cas9蛋白高效进入细胞核。3.低脱靶效应:Cas9核酸酶的瞬时表达提高了切割的特异性。4.节省时间:无需转录和翻译过程。这种核酸酶可以用于体外DNA切割筛选高效和特异性靶向gRNA,以及通过电穿孔或注射与特定gRNA结合时的体内基因编辑。产品的保存条件通常是在-25~-15℃,有效期为一年。使用时,可以根据推荐的反应体系进行体外DNA裂解实验,并通过琼脂糖凝胶电泳检测消化效率。具体产品的详细信息和应用指南,可以参考金斯瑞生物科技有限公司、NEB、金斯瑞、YEASEN和Novoprotein等公司提供的资料。Probe qPCR Mix (2×)通常含有热启动DNA聚合酶,这种聚合酶在高温下激发,可以减少非特异性扩增 。
PreScissionProtease(PSP)是一种由人鼻病毒14型的3C蛋白酶(humanrhinovirus(HRV)type143Cprotease)和GST组成的融合蛋白。它具有以下特点:1.**特异性识别**:PreScissionProtease能在低温下(4°C)特异识别短肽Leu-Glu-Val-Leu-Phe-Gln-Gly-Pro,并在Gln和Gly氨基酸残基之间进行酶切。2.**依赖结构**:底物的识别和切割不仅依赖于融合蛋白的一级结构,还依赖于融合蛋白的二级和三级结构。3.**分离GST标签**:它可以特异性的将pGEX-6P系列等载体表达出的带有酶底物识别多肽序列融合蛋白的GST标签进行分离。4.**表达宿主**:本品由大肠杆菌中重组表达,并以无菌液体形式提供。5.**物理性质**:分子量约为46kDa,物理外观为无菌无色液体。6.**储存缓冲液**:25mMTris-HCl(pH8.0),150mMNaCl,1mMEDTA,5mMDTT,50%(V/V)Glycerin。7.**酶切缓冲液**:10×酶切缓冲液为500mMTris-HCl(pH7.0),1.5MNaCl,10mMEDTA,10mMDTT。8.**纯度**:经SDS-PAGE及HPLC分析,纯度大于95%。9.**酶活定义**:在5℃条件下反应16小时,能够切割10µg的GST标签的融合蛋白达90%以上所需的酶量定义为一个活性单位。Taq DNA Polymerase 能够在相对较高的温度下保持稳定,其适催化温度在75-80°C。Recombinant Rat Coagulation Factor IIProtein,His Tag
Pfu DNA Polymerase 适合扩增较长的DNA片段,有助于在基因编辑中处理大的基因区域或复杂的基因结构。Recombinant Mouse FAM3D Protein,hFc Tag
在基因编辑中,除了NLS-Cas9-EGFPNuclease,还有多种技术可以提高编辑的特异性,这些技术包括:1.**高保真Cas9变体**:通过工程化改造Cas9蛋白,例如使用SpCas9-HF1或eSpCas9等高保真变体,可以减少脱靶效应,提高特异性。2.**碱基编辑器(BaseEditors)**:这类编辑器可以在不产生DNA双链断裂的情况下直接在特定位置进行单个碱基的转换,从而减少非目标编辑。3.**引导编辑器(PrimeEditors)**:由哈佛大学刘如谦教授团队开发的引导编辑器可以在不依赖DNA双链断裂和同源定向修复的情况下,实现精细的基因组编辑。4.**CRISPRi和CRISPRa**:这两种技术分别用于抑制或激起特定基因的表达,而不切割DNA,从而减少了脱靶风险。5.**新型CRISPR系统**:例如CRISPR/Cas12j和CRISPR/CasΦ,这些系统可能具有不同的PAM序列要求和更高的特异性。6.**AI辅助设计**:利用人工智能预测和优化sgRNA的设计,以减少脱靶效应。7.**优化递送系统**:改进CRISPR组分的递送方法,例如使用核糖核的蛋白(RNP)复合物,可以提高编辑效率和特异性。8.转座子编辑系统:利用转座子进行基因组编辑,可以在不依赖DNA双链断裂的情况下实现大片段DNA序列的插入。
磁珠法质粒小量抽提试剂盒是一种利用磁性纳米颗粒固相核酸富集技术来纯化质粒DNA的产品。它通常包括高性能纳米磁珠和独特的缓冲体系组合,通过裂解菌体后释放的DNA,能够有效地结合于磁珠表面,漂洗除杂后获得高质量的目的质粒。以下是磁珠法质粒小量抽提试剂盒的一些主要特点和应用:1.**快速简便**:操作步骤简单,无需多次离心,整个抽提过程通常只需20-25分钟。2.**高得率和纯度**:可以从1-5ml新鲜大肠杆菌菌液中分离纯化2-20µg高质量的质粒DNA。纯化得到的DNA质量高,完整性好,OD260/280比值一般为1.8~1.9之间,OD260/230比值大于2.0。3.**适用性广**:适用于...