核酸提取方法的选择:本研究发现手工过柱提取的方法漏检率较低,而且敏感性比其他方法更高,但该方法耗时较长,尤其样本量大时,频繁的离心过柱使得时间成本很大增加,所以并不推荐用于大批量样本的筛查;而磁珠法由于能配合使用自动核酸提取仪,所以能有效节约时间和人工成本,非常适合对大批量样本的核酸提取,但本研究中所使用的两种磁珠提取方法,进口试剂的提取效果明显高于国产试剂,这提示国内的生产商要不断提高产品质量与技术含量,从而降低国内检测机构对国外试剂的依赖性。对于一步检测法来说,由于该法光光将10 μl的样本加入至反应体系中,降低了病毒在反应体系中的存在概率。由于该法漏检率高且敏感度较低,所以并不推荐使用。核酸提取仪需要注意的事项:远离带电电路。上海全血核酸提取推荐
核酸提取纯化方法:1.酚/氯仿抽提法1956年发明,通过酚/氯仿处理细胞破碎液或者组织匀浆后,在水相中主要溶解以DNA为主的核酸成分,在有机相中主要是脂类物质,蛋白质位于两相之间。2.醇沉淀法乙醇能够消除核酸的水化层,使带负电荷的磷酸基团暴露出来,NA﹢等带正电荷离子能与磷酸基团结合,形成沉淀。3.层析柱法通过特殊硅基质吸附材料,能够特定吸附DNA,而RNA和蛋白质顺利通过,然后利用高盐低PH结合核酸,低盐高PH值洗脱,来分离纯化核酸。上海自动核酸提取销售厂家核酸分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两大类。
磁珠结合效率决定了有多少核酸可以吸附到磁珠上,即洗脱核酸的上限。影响结合效率的因素有磁珠的吸附能力以及结合缓冲液的结合能力。磁珠吸附能力:磁珠提取系列磁珠一般是硅羟基磁珠,磁珠吸附能力受到磁珠比表面积以及修饰基团的密度影响。一般选择修饰基团多,比表面积大的磁珠,一般磁珠粒径越小,比表面积越大。但也不是磁珠粒径越小越好,磁珠粒径小,吸附速度也会变慢,可根据实际样本情况自行选择。结合缓冲液一般用异丙醇或乙醇结合。通常可以通过提高醇的比例来增强结合能力,同时也要提高离液盐的浓度来促进核酸与磁珠的结合。
核酸抽提原理:去污剂则是通过使蛋白质变性,破坏膜结构及解开与核酸相连接的蛋白质,从而实现核酸游离在裂解体系中。裂解体系中还可能加入蛋白酶;利用蛋白酶将蛋白质消化成小的片段,促进核酸与蛋白质的分开,同时,也便于后面的纯化操作以及获得更纯的核酸。也有直接使用高浓度的蛋白质变性剂(如GIT、GuHCl等)裂解的,该方法已经成为了RNA抽提的主流,却不是基因组DNA抽提的主流。好常用的纯化方法,一是PC抽提+醇沉淀,二是介质纯化。第一种方法是利用PC对裂解体系进行反复抽提以去除蛋白质,实现核酸与蛋白质的分离;再用醇将核酸沉淀下来,实现核酸与盐的分离。核酸提取仪需要注意的事项:避免将仪器放置在靠近热源的地方。
电泳区分核酸大小:核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,琼脂糖凝胶电泳即根据这个原理对核酸进行区分。核酸分子在pH高于其等电点的溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于核酸的戊糖-磷酸骨架在结构上具有重复性,长度相同的核酸链几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。此外,含有琼脂糖的凝胶具有网状结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在琼脂糖凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就较大提高了分辨能力。在同样电场的强度下,核酸分子的迁移速度取决于核酸分子本身的大小和构型以及琼脂糖凝胶的浓度,简而言之,分子量较大的核酸迁移速度较慢,分子量较小的核酸迁移速度较快,这就是应用凝胶电泳技术分离核酸片段的基本原理。核酸研究中还有一个常用的工具,叫做限制性核酸内切酶。青岛全血核酸提取哪家质量好
磁珠分离技术是一种简单高效的核酸提纯方法。上海全血核酸提取推荐
核酸提取纯化方法:1.热裂解碱法碱法提取主要是利用共价闭合环状质粒与线性染色质在拓扑学上的差异来分离他们,在碱性下,变性蛋白是可溶的。2.煮沸裂解法加热处理DNA溶液,利用线性DNA分子的特性,通过离心将DNA段与变性蛋白质和细胞碎片形成的沉淀分离。3.纳米磁珠法运用纳米技术对超顺磁性纳米颗粒的表面进行改良和表面修饰后,制备成超顺磁性氧化硅纳米磁珠。该磁珠能在微观界面上与核酸分子特异性地识别和高效结合。利用氧化硅纳米微球的超顺磁性,在Chaotropic盐(盐酸胍、异硫氰酸胍等)和外加磁场的作用下,从血液、动物组织、食品、病原微生物等样本中分离出DNA和RNA。4.其他方法除了上述常用的方法之外,还有超声法、反复冻融法、酶解法及低渗裂解等等多种方法。上海全血核酸提取推荐