GlycOCATCH设计用于特异性结合粘蛋白型O-糖基化蛋白和肽。亲和树脂基于无活性的Genovis的OpeRATOR酶，该酶经过工程设计，可以高亲和力结合O-糖基化蛋白和肽。 结合在pH 5-8的生理缓冲液中进行。由于GlycOCATCH树脂和O-糖蛋白/肽之间的强相互作用，可以用8M尿素进行洗脱。或者，可以使用活性OpeRATOR酶进行洗脱，该酶消化O-聚糖位点的N末端结合的O-糖蛋白。在后一种情况下，肽在天然条件下回收。OpeRATOR 冻干酶包含在购买中。由于 O-糖蛋白上的旋亚氨酸化 O-聚糖与树脂结合效率更高，因此唾液酸酶混合物 SialEXO 冻干也包含在购买中。FucosEXO 在1小时内对所有三种 TNFR 蛋白去岩藻糖磺酸处理。陕西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
蛋白质的N-糖基化特征是一个关键的质量属性。它会影响生物制药的安全性和有效性，因此需要在开发和生产过程中进行表征和监测。常见的聚糖分析工作流程是用PNGase F释放N-聚糖，然后用荧光标记物（如2-AB、2-AA、普鲁卡因胺或RapiFluor-MS™（沃特世公司））标记生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛细管电泳分离标记的聚糖，以表征和定量不同的聚糖结构。 在这里，使用游离聚糖方法分析zhiliao性抗体曲妥珠单抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠单抗和依那西普在天然条件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小时，而RNase B需要变性和还原才能完全去糖基化。因此，在50°C下用PNGase F去糖基化10分钟之前，用RapiGest™ SF表面活性剂（沃特世公司）和TCEP处理RNase B。 用RapiFluor-MS标记所得游离的聚糖，并通过HILIC UPLC-FLD-MS进行分析。N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶，用于在z终样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。
当在完整状态下进行分析时，EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可以有效地去除 N 糖（含有PNGase F酶）和 O-糖，如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖，因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议（在37°C下进行O/N孵育），两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理，并显示数据以供比较。另一方面，N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近，或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态，就根本无法接近。因此，这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。
OglyZOR 来源于口腔链球菌，在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 227 kDa。SialEXO来源于Akkermansia muciniphila，在大肠杆菌中表达。SialEXO酶含有His标签，组分的分子量分别为42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶；2. 降低样品异质性，揭示潜在的关键蛋白质修饰；3. 完全、稳健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的冻干酶，用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 个单位的小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助剂才能发挥作用，因此与2000单位的SialEXO冻干一起提供。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。
Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用，但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖，对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后，曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除，与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比，没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。GalNAcEXO冻干剂以冻干粉末的形式提供，装在2000单位的小瓶中，用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc残基。陕西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
PNGase F 以冻干粉的形式提供，装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中，分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。陕西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 （EPO） 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质，其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置，因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。陕西冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶生物药物开发
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