Co-IP实验的外源检测与内源检测各有其优缺点。外源检测的优点在于其可控性高,能精确地表达目标蛋白及其标签,且背景清晰,易于检测。此外,外源检测系统通常更为敏感,能够检测到较弱的相互作用。然而,其缺点也显而易见,即不能完全模拟体内的真实环境,可能导致某些体内特有的相互作用无法被检测到。内源检测则能更真实地反映生物体内的蛋白质相互作用情况,因为它直接利用细胞内的天然蛋白。然而,这种方法的挑战在于细胞内蛋白表达的复杂性和多样性,可能导致背景噪声高,难以准确检测目标蛋白。此外,内源检测的灵敏度通常较外源检测低。综上所述,选择外源检测还是内源检测,需根据实验目的和具体情况来权衡。如需高灵敏度和可控性,可选择外源检测;如需更真实地模拟体内环境,内源检测可能更为合适。Co-IP实验需注意抗体选择、样品处理、操作细节、条件优化及结果验证,确保准确可靠!河南免疫共沉淀检测CoIP Mass检测
对于Co-IP实验初学者,常遇到的“坑”主要有:首先,抗体选择至关重要。选择特异性不强或亲和力低的抗体,可能导致非特异性结合,干扰实验结果。因此,选择经过验证的高质量抗体是关键。其次,实验操作规范不容忽视。细胞裂解不充分、洗涤不当等都会影响蛋白复合物的纯化,进而影响实验结果。初学者应严格按照步骤操作,确保每一步都精确无误。再者,结果解读需谨慎。初学者可能因经验不足,误将非特异性结合视为真实相互作用。因此,解读结果时,需结合其他实验方法如Western Blot进行验证。另外,实验安全不可忽视。遵守实验室规章制度,注意个人防护和实验室卫生,是确保实验顺利进行的基础。综上所述,初学者在进行Co-IP实验时,应关注抗体选择、实验操作、结果解读和实验安全等方面,通过不断学习和实践,逐渐积累经验,避免常见错误。江苏免疫沉淀CoIP WBCo-IP实验检测:制备样品、裂解细胞、免疫沉淀、WB检测!
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:
互作蛋白筛选和验证:数据分析以非标定量信号强度(LFQintensity和FC>10)作为强阳筛选,以文献查阅,功能匹配,批量CoIP-WB验证,提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考(相对强信号和差异),分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白,作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析,文献分析,目的蛋白功能匹配分析,选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证,提高CoIP-WB成功率。
免疫共沉淀CoIP实验,细胞的收集及裂解方法如下:
收集2E7个细胞样品,加入PBS洗涤细胞,离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF,混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀,冰上孵育30min,期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min,取上清,进行蛋白浓度测定及后续实验。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力您的互作机制研究,欢迎垂询合作。 免疫共沉淀法可信度高,可发现新蛋白搭档,但存局限,需结合其他方法验证。
Co-IP(免疫共沉淀)技术被广泛应用于生物学和医学研究领域,特别是在蛋白质相互作用、信号转导、疾病机制等方面。因此,许多从事这些领域的研究人员都在使用Co-IP技术。以下人员可能会使用Co-IP技术。生物医学研究人员:在研究疾病的发生机制、信号转导通路、蛋白质相互作用网络等方面,经常利用Co-IP技术来验证和发现新的分子机制。药物研发人员:在药物研发过程中,通过Co-IP技术来鉴定和验证药物与特定蛋白质相互作用的分子机制,以评估候选药物的有效性和选择性。蛋白质组学研究人员:利用Co-IP技术结合质谱分析,对蛋白质相互作用网络进行高通量鉴定和分析,揭示蛋白质在生命过程中的功能和调控机制。基础医学研究人员:在研究细胞生物学、分子生物学等基础医学领域时,也会使用Co-IP技术来探索蛋白质之间的相互作用和调控关系。Co-IP技术可靠,但需注意潜在限制与影响因素,综合验证确保准确性!河南免疫共沉淀检测CoIP Mass检测
CoIP实验需设对照组,排除非特异结合,确保结果准确可靠!河南免疫共沉淀检测CoIP Mass检测
CoIP-Mass应用场景:CoIP-Mass:用于构建目的蛋白的蛋白互作组数据,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。CoIP-WB:用于验证目的蛋白和候选蛋白的相互作用关系,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作变化。
CoIP-Mass和CoIP-WB技术价值:(1)蛋白质相互作用数据是机制研究的重要基础内容,体现机制研究的严谨性,能明显提高临床基础类研究文章的档次。(2)细胞内蛋白互作处于动态变化过程,在不同条件下可发生动态变化,蛋白动态互作组检测,是蛋白互作机制的亮点。(3)蛋白互作,往往是结构域或部分关键区段的互作,可通过蛋白区段拆分,进一步明确互作的结构域,提升机制研究的高度,为靶点转化提供关键切入点。 河南免疫共沉淀检测CoIP Mass检测