北京脱靶检测评估

脱落与传播。对于部分有ganran或复制能力的基因zhiliao产品，从受试者者体内排出或脱落到自然环境后，可能会传播给受试者的密切接触者，包括患者亲属和医护人员等，进而产生病毒传播或ganran风险。其他考虑因素。除产品相关因素外，基因zhiliao产品的长期风险评估还应考虑靶细胞/组织/qiguan，患者群体（年龄、免疫状态、死亡风险等）和相关疾病的特征以及合并其他zhiliao的影响。如果基因zhiliao产品可在生殖腺、生殖细胞等组织qiguan中分布并发挥作用，可能对受试者或其配偶的生育能力、妊娠以及胎儿产生难以预测的迟发性影响。高精度脱靶检测，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。北京脱靶检测评估

R-loop seq虽然不是一种真正意义上的脱靶位点检测方法，但能为碱基编辑脱氨酶的脱靶提供一种度量方法，以便于之后的脱氨酶点突变优化，来降低脱靶的发生几率。2) Detect-seqCRISPR衍生技术由于其复杂性，检测其脱靶位点的hexin思路是捕获实验过程中的关键中间产物或者终产物。这种设计思路下，目前较为成功的是检测碱基编辑CBE脱靶位点的Detect-seq[13]。CBE的原理是将dC脱氨变为dU，迫使其对侧的dG变为dA，较终将碱基对从C-G转变为T-A。Detect-seq便是针对中间态的dU，使用Uracil DNA Glycosylase (UDG)，去除U碱基后，替换为带Biotin的U碱基，捕获碱基编辑的脱靶位点，并且sgRNA依赖和sgRNA不依赖的脱靶位点都能找到。该方法类似检测DNA甲基化的重亚硫酸盐测序法，通过处理特定的碱基，可以捕获全基因组上的CBE脱靶位点。武汉off-target脱靶检测安全性评价如何检测是否发生脱靶？

对于CAR修饰的免疫细胞，应采用多种体外方法评估其胞外抗原识别区的脱靶风险。TCR修饰免疫细胞的脱靶毒性可通过评估TCR与人体自身抗原肽的交叉识别能力来评估。首先，应采用体外试验测定TCR修饰的免疫细胞与人自身抗原肽-HLA（与递呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）复合物的亲和力，并说明抗原肽的选择依据及选择范围。此外，还应研究其他相关或不相关的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR与人自身抗原肽有交叉反应可能，应确定靶抗原肽的较小识别基序（motif），并采用计算机预测分析评估交叉反应性。如果计算机预测可识别出具有潜在交叉反应性的抗原肽，应在体外测定TCR修饰免疫细胞对表达相应蛋白或递呈相应抗原肽的的细胞的识别能力。如果不能排除交叉反应性，应基于含有潜在交叉反应性抗原肽的蛋白的表达模式以及TCR与潜在交叉反应性抗原肽的亲和力来进行风险评估。为获得TCR与其他等位HLA潜在交叉反应性的信息，应进行充分的HLA交叉反应性筛选。

但是由于CHIP-seq实验本身的难度较高，DISCOVER-seq这类方法的接受度并不高。3. 其他特殊方法CRISPR技术经过这么多年的发展，其应用已经不局限于造成DNA双链断裂，一些不要切割DNA双链的CRISPR衍生技术（如碱基编辑、先导编辑和CRISPRi/a），可以在不引发随机突变的情况下，对基因组进行精细编辑或者调控。这些技术所使用nCas9或dCas9只结合或者切割双链中的一条链，之前的脱靶检测方法都不能直接适用。这些CRISPR衍生技术中，CRISPR产生的脱靶可以被细分为两个部分，其一是Cas9/sgRNA结合DNA导致的脱靶，这部分信息使用同样序列的sgRNA进行野生型Cas9脱靶位点检测能够间接得到通过对DSB的标记实现了全基因组无偏脱靶检测，如IDLVs、BLESS、GUIDE-seq技术等。

脱靶来自于这些技术所携带的功能基团，如碱基编辑的脱氨酶和先导编辑的逆转录酶，不依赖sgRNA结合基因组DNA的情况下产生的脱靶。为检测第二类脱靶现象，研究者需要针对每种技术设计专门的检测方法。1) R-loop seq在碱基编辑开发早期，虽然靶位点的编辑效率很高，但研究者也很快发现脱氨酶会在游离的时候随机修饰暴露的DNA单链，导致大量的脱靶位点。为降低这类脱靶现象的发生，研究者设计了R-loop seq，以dSaCas9结合DNA形成R-loop，暴露出DNA单链，为碱基编辑的脱氨酶提供一个固定的脱靶位点，然后以该位点的编辑效率反映碱基编辑脱氨酶的脱靶程度。可以与靶基因之外的其他基因作用而非特异性阻断基因表达,即产生非靶基因的沉默效应。江苏育种脱靶检测服务

内基因编辑技术可能造成的脱靶效应。北京脱靶检测评估

BLESS：利用生物素标签对DSBs进行原位标记，后经PCR扩增实现对于生物素标记片段的富集，并通过二代测序实现脱靶位点检测。直接检测细胞中的切割位点，灵敏度与细胞、组织密切相关。LAM-HTGTS，片段化的gDNA经过LAM-PCR引入接头，然后进行全基因组易位测序。高通量的全基因组范围检测，可准确检测DSBs引发的重排。GUIDE-Seq，将dsODN    s标签整合到DSBs位点，通过二代测序检测这些标签所在的基因组区域，从而确定脱靶突变的位置。广使用的细胞内检测方法。能检测低频脱靶突变。Digenome-Seq，片段化的gDNA与CRISPR/RNP混合孵育，进行全基因组测序检测脱靶。全基因组测序，直接检测切割位点，能检测低频脱靶突变。北京脱靶检测评估