细胞经基因修饰后会改变其生物学特性,同时也会带来新的安全性风险,如基因编辑脱靶风险、载体插入突变风险、载体重组风险、表达的转基因产物的风险等。细胞经基因修饰后会改变其生物学特性,同时也会带来新的安全性风险,如基因编辑脱靶风险、载体插入突变风险、载体重组风险、表达的转基因产物的风险等。基于基因修饰细胞的产品种类繁多、各有特点,除上述一般技术要求外,还应基于产品的性进行相应的特殊考虑。本指导原则列举了以下三种情形的特殊考虑。定量脱靶检测,推荐唯可生物,实验实力强,专业性高,检测效率高,结果准确率高。无锡定量脱靶检测安评
目前鼓润已掌握了该项技术,简述如下:1、CRISPR与dsODNtag整合的实验技术及高通量测序建库流程将靶向于目标基因组位点的CRISPR质粒与dsODNtag以核电转的方式同时转染入真核细胞,CRISPR造成基因组双链断裂后,dsODNtag将整合入断点处,作为后续分析在靶与脱靶情况的标记。转染后3天收集细胞的DNA进行高通量建库。2、GUIDE-seq生信分析方法1)搭建了高通量测序的数据分析流程。2)利用该技术分析了CRISPR靶向编辑某细胞系基因的在靶与脱靶情况。其中一例样品的分析结果如图4所示:Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-seq.Theintendedtargetsequenceisshowninthetoplinewithcleavedsitesshownunderneathandwithmismatchestotheon-targetsiteshownandhighlightedincolor.GUIDE-seqsequencingreadcountsareshowntotherightofeachsite.3)利用PCR扩增技术联合Sanger测序鉴定了分析出的脱靶位点。无锡基因疗法脱靶检测实验室检测脱靶效应比较好的方法:CIRCLE-seq。
临床研究人群,如果一种基因zhiliao产品具有引起迟发性不良反应的风险,需要开展长期随访观察时,所有接受基因zhiliao产品的受试者在签署知情同意书后均应入组长期随访临床研究。在设计长期随访临床研究的方案时,应考虑目标受试者人群及特征、整体健康情况以及接受zhiliao的患者的预期生存期等特征对迟发性不良反应的收集的影响。通常来说,当临床研究人群的某些特征(如预期寿命短、多重合并症、以及暴露于放疗或化疗等其他药物)可能干扰迟发性不良反应的观察分析时,会影响长期随访观察在评估和减轻受试者风险方面的效用;而在病情较轻或较局限,合并症以及伴随zhiliao有限或较稳定的受试者中,通过长期随访观察收集到的评估数据可能更容易分析。
近几年,细胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)领域发展迅猛,在多个方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA为代的多种CAR-T免疫细胞疗法攻克了一部分血液瘤,多种AAV疗法也给一些难以成药的罕见病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因编辑技术的众多基因疗法也进展迅速,较早体外基因编辑疗法较快今年年底能够上市(CRISPR Therapeutics CTX001),体内基因编辑疗法取得了不错的临床数据(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技术制造的通用型CAR-T疗法也是免疫细胞疗法发展的一大趋势(Caribou Biosciences CB-010)。基因编辑治疗过程中安全性评价,即脱靶效应的检测。
由于设计的sgRNA会与非靶点DNA序列错配,引入非预期的基因突变,即脱靶效应(Off-targeteffects)。脱靶效应造成了研究中的许多不确定性,这无疑限制了该技术的应用。因此,研究者希望能开发有效的方法来检测脱靶效应。在目前主流的脱靶效应评估方法中,有一种方法为GUIDE-seq,其原理是利用一种短的双链寡聚核苷酸(dsODN)标记CRISPR/Cas诱导的脱靶断裂,然后对标签所在的基因组区域进行高通量测序,通过生物信息学分析从而确定脱靶位点。利用该技术可以在基因组范围内检测CRISPR脱靶效应,从而改变了以往先预测假定脱靶位点再检测的思路;与其他的评估方法相比,GUIDE-seq更精确、更灵敏。脱靶切割位点已在基因编辑技术,CRISPR / Cas9,ZFNs和TALEN。嘉兴基因疗法脱靶检测政策
如何降低脱靶效应?选择特异的gRNA; 使用RNP; 使用eSpCas9的质粒; 使用Nickase Cas9。无锡定量脱靶检测安评
以上长期随访时间的建议主要基于基因zhiliao的产品类型,具体产品的随访时间取决于产品的特性和体内存在时间、转基因表达时间、迟发性不良反应的预期时间及发生率、受试者适应症和预期生存期、给药途径、以及长期随访的其他观察目的。随着随访数据的积累,研究者和研究申办方可能会根据产品的存在情况、转基因表达和临床表现的持续评估情况,延长或缩短长期随访的持续时间。如果研究申办方认为其基因zhiliao产品安全性风险较低、无需开展长期随访临床研究,或者希望变更随访时间,应合理说明依据或变更理由并与药品监督管理部门进行沟通。无锡定量脱靶检测安评