大多数研究级别的慢病毒是通过批次浓缩而不是粗制剂之后应用的，浓缩基本上是通过两步离心法产生的。在70000g通过超速离心浓缩后的慢病毒再通过蔗糖缓冲(50000g)纯化，然后溶解在配方缓冲液中。一种改进，特别是纯度方面的改进，基于离心/色谱联用的纯化方法。例如，Kutner等评估了组合纯化/浓缩方法。蔗糖缓冲的超速离心结合阴离子交换层析获得了88.2%的收率，而相反的组合则获得了77.6%的收率。在两种方法中，浓缩都超过了100倍，病毒滴度都超过了1010TU/ml(VSV-g包被的慢病毒)。M-SAN HQ中盐核酸酶不含动物源成份，无蛋白酶活性；湖北ArcticZymes中盐核酸酶70950-150
细胞基因药物领域的进展使得对高质量基因转移技术的需求急剧增加，包括高质量慢病毒载体(LV)的大规模生产。宿主细胞DNA残留（HCD）是一类主要的工艺相关杂质，对下游纯化带来很大挑战。根据相关法规要求，需要去除HCD才能达到临床级LV。HCD去除是通过核酸酶处理联合下游工艺（DSP）共同实现的。文章作者研究了两款核酸酶M-SAN HQ中盐核酸酶(ArcticZymes Technologies)和Benzonase(Merck)对HCD去除效率的差别，其下游工艺包含过滤澄清及TFF超滤。上海等渗条件中盐核酸酶中盐核酸酶的生产在符合ISO13485:2016体系基础上，增加了cGMP相应要求。
Medium-Salt Active Nuclease High Quality (M-SAN HQ，中盐核酸酶)，是用Pichia pastoris表达的重组非特异内切核酸酶，广泛应用于生产工艺流程中，在生理盐条件下去除双链及单链的DNA及RNA。这款核酸酶的适宜pH范围很广（pH 7.2-8.7），且在125-250 mM盐浓度内具有适宜活性。在细胞培养液或收获的培养上清中，不需调整任何组分，直接加入M-SAN HQ即可表现高核酸酶活性。相比传统的全能核酸酶，M-SAN HQ中盐核酸酶在生理盐条件下，对HCD的去除更高效、更彻底。因此，M-SAN HQ中盐核酸酶非常适合部分病毒载体（如慢病毒、逆转录病毒及溶瘤病毒等）的生产。
跟其他类型的核酸酶一样，SAN HQ高盐核酸酶和M-SAN HQ中盐核酸酶的灭活方法有很多，分为可逆灭活及不可逆灭活。金属离子螯合剂如EDTA会可逆抑制两者的活性，加入的EDTA浓度一般是溶液中Mg2+浓度的2倍左右即可完全抑制活性；后续补加过量的Mg2+即可恢复核酸酶活性。加热、还原剂（如DTT）、咪唑、甘油及表面活性剂（如高于15%浓度的Triton X-100、SDS、尿素等）等都可以使其不可逆失活。在生物工艺流程，需要结合上下游应用需要选择合适的方法去除或灭活核酸酶。相比全能核酸酶，M-SAN HQ中盐核酸酶能将HCD酶切成更小片段，破坏核小体结构。
除了获得载体的滴度及产量，生产慢病毒更关心的指标主要是各种污染物的去除。总DNA污染的去除百分比在99.1-99.84%，总蛋白污染物的去除百分比在99.85-99.9%。针对宿主细胞的DNA（HCD）及蛋白（HCP），有报道其去除百分比分别为99.8%和99.4%。因为不仅残存的DNA可能是个问题，而且DNA的大小以及由此引起的可能转移整个有功能的开放阅读框也是问题，因此监管机构对残存DNA污染的分子量上限的要求越来越高。例如，FDA的指南‘生产用于传染病适应症的病毒疫苗的细胞基质和其他生物材料的特性和鉴定’中说明，残留的细胞宿主的DNA片段不能超过一个功能基因的长度，估计在200bp左右。在150mM NaCl条件下，M-SAN HQ中盐核酸酶的酶切活性达到常规核酸酶的5倍左右。湖北ArcticZymes中盐核酸酶70950-150
M-SAN HQ中盐核酸酶是用Pichia pastoris表达的重组非特异内切核酸酶。湖北ArcticZymes中盐核酸酶70950-150
慢病毒大规模纯化的捕获步骤包括：膜过滤澄清，随后切向流过滤/超滤或者体积排阻色谱浓缩。此外，需用核酸酶（benzonase或M-SAN HQ中盐核酸酶）来去除细胞残留的、质粒来源的DNA污染。这两个步骤顺序可以调整，依据项目工艺而定。两种工艺路线各有优缺点：先用核酸酶消化的优点是可去除大的DNA片段，且后续步骤可以去除残留核酸酶；但所用的核酸酶的量也非常大。与此相反，将核酸酶步骤后置的优点是大幅降低核酸酶的量(成本降低)；但后面的步骤必须有将核酸酶去除的能力。此外，后期用核酸酶的缺点是核酸污染可能会结合慢病毒颗粒形成沉淀，进而导致慢病毒在纯化中流失，从而影响得率。湖北ArcticZymes中盐核酸酶70950-150
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