电子病历系统与传统的HIS的不同。从电子病历的角度看病人信息，是完整的、集成的；而从传统的 HIS 的每个子系统来看病人信息，是局部的、离散的，相互之间信息有冗余、有遗漏，它们往往没有按照一个统一的原则进行设计和管理。在内容上，有不同的侧重和要求。比如：以统计和检索为目的的病案首页管理对病人的诊断只要录入保存ICD码即可，而从电子病历的角度则必须要完整地保留医生的诊断描述，诊断描述与ICD分类码不能相互取代。电子病历强调病人信息的原始性和完整性。有了以电子病历为中心的医疗信息系统，医疗工作的过程将会有很大的变化。杭州中小医院专科电子病历基本功能
电子病历是医院中医疗信息系统的中心。医疗信息系统的主要功能是为医院的医疗提供信息服务，其各项功能都是建立在对病人的病历信息进行处理的基础上。它包括：①病人的姓名、性别等自然信息。②病人的入院、出院、转科、转院等流行情况。③病人在医院所接受的各种检查记录。④医师为病人所做的各种医疗记录。⑤对病人的护理记录等。引入电子病历概念后，正在使用的纸病案一般被称做传统病历，随着我国医改试点的成功，医改的成功经验正在不断地向其它地区传播，在医疗变革过程中医疗诊所和医院实行办公自动化、病历电子化的转变，对于电子病历进行医疗数据转换是一个非常重要的问题。病历管理使用注意事项电子病历支持修改痕迹保留，保留各级医生的修改痕迹。
电子病历手工录入转换，就是将以前的纸质病历，通手工把旧病历的数据输入到新上线的电子病历系统中，虽然手工转换这个工作非常单调乏味，耗费较长时间，但是可以借此机会整理全部文件，去除不再就诊或已经搬家的患者病历。在此过程中，还可以建立新的病历，而无需体验因为使用不同架构导入数据带来的压力。例如，纸质儿科医生办公系统的图表可能以家族为单位进行管理，而不是以个人为单位管理。在新的数据库中这些图表的分类可能又会有所不同，因为在新数据库中病人分类的主要依据是他们的社会保险号(Social Security Number，SSN)。
究竟什么是电子病历，学术界至今仍缺乏统一的认识。根据研究，理想的电子病历应当具有两方面功能：1．医生、患者或其它获得授权的人，在需要了解一个个体的任何健康资料或相关信息时，在任何情况下都可完整、准确、及时获得它们，并可得到准确的释义，在需要时可以较大限度地得到详细、准确、全方面的相关知识。2．电子病历可以根据自身掌握的信息和知识，主动进行判断，在个体健康状态需要调整时，做出及时、准确的提示，并给出较优方案和实施计划。电子病历并不是病历书写这么简单，病历是各种医疗活动的结果记录。
电子化病历系统的用途包括什么？提高举证：病历是具有法律效力的医学记录，为医疗事故鉴定、医疗纠纷争议提供医疗行为事实的法律书证，如遇到法律纠纷时，没有书写的内容被视为没有询问、检查，那么法院将视为过失，这将对医院造成很大的被动，甚至是损失。通过符合规范的病历记录，避免了语义模糊、书写潦草、缺页、漏项等问题，减少了可能出现的会对医院各方面造成不良影响的、但是可以避免的错误，为举证倒置提供有力的法律依据。不只维护了医院和医务人员的合法权益，而且对医院名誉、经济效益都能带来益处。电子病历主要功能有：病历模板库。病历管理使用注意事项
电子病历系统拥有智能知识库，辅助医生确立医疗方案。杭州中小医院专科电子病历基本功能
病历是病人在医院诊断医疗全过程的原始记录，它包含有首页、病程记录、检查检验结果、医嘱、手术记录、护理记录等等。电子病历（EMR）不只指静态病历信息，还包括提供的相关服务。是以电子化方式管理的有关个人终生健康状态和医疗保健行为的信息，涉及病人信息的采集、存储、传输、处理和利用的所有过程信息。有关医学研究所将定义为：EMR是基于一个特定系统的电子化病人记录， 该系统提供用户访问完整准确的数据、警示、提示和临床决策支持系统的能力。杭州中小医院专科电子病历基本功能
