堀越氏芽孢杆菌(Bacillus horikoshii)是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌,也是国际公认的模式菌株(ATCC 700161)[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性,可形成椭圆芽孢,更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃,在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢,被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白(mnh、nhaC)和碳酸酐酶,可将胞内多余Na⁺排出,并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻,维持胞内pH稳态;细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸,增强膜稳定性,为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10,90 ℃半衰期>2 h,已用于淀粉糖化“一步法”,可省略传统工艺中的中和环节,节能15 %;耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍,低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能:在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下,仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹,同时胞外多糖吸附Cd²⁺,使水稻籽粒镉含量下降35 %,产量提高18 %。
玉米乳杆菌(Lactobacillus zeae)是乳杆菌属中一颗“低调却高效”的新星,更早从传统发酵玉米浆中分离得名。菌体细长、无芽孢、不运动,兼性厌氧,更适温度35~40℃,可在pH 3.8的酸环境中存活,耐胆盐0.3%,但对氧敏感,需借助玉米基质中的还原力维持活性。基因组只2.0 Mb,却携带完整的磷酸酮醇酶与双歧途径,能同步发酵葡萄糖、蔗糖和玉米特有的棉子糖,产乳酸量可达18 g/L,同时分泌少量乙酸和乙醇,赋予发酵液清爽微酸的风味。在工业应用上,玉米乳杆菌是“玉米黄金”的关键酿造者。将其与酿酒酵母共培养,可将玉米浆在24小时内酸化至pH 3.9,抑制杂菌,提升原料利用率12%;其胞外多糖还能增加饮料黏度,减少增稠剂添加。动物试验显示,日粮添加10⁷ CFU/g玉米乳杆菌,可使断奶仔猪平均日增重提高9.3%,腹泻率下降42%,并通过上调紧密连接蛋白Claudin-1,增强空肠屏障功能。更引人注目的是,该菌能合成玉米黄素(zeaxanthin)前体,为功能性食品提供天然护眼成分。随着非乳基益生菌需求激增,玉米乳杆菌凭借“源自玉米、用于玉米”的闭环优势,正成为植物发酵饮品的下一代关键菌株。草状珊瑚状放线菌该菌的耐热密码在于:细胞膜富含支链脂肪酸和钙-吡啶二羧酸复合物,降低膜流动性。

特基拉芽孢杆菌(Bacillus tequilensis)是芽孢杆菌属中一颗快速升起的新星。更早在墨西哥酒窖的橡木桶中被发现,它可在60℃、8%乙醇或含砷10g/L的废水中保持活性,芽孢能休眠十年不死,被视作“极端环境基因库”。其抗逆机制由“吸附-代谢-固定”三级网络组成:ArsR-arsB-arsC操纵子把As³⁺氧化为低毒As⁵⁺并泵出胞外;组氨酸富集蛋白Teq可吸附Au³⁺、Cd²⁺,吸附量达50mg/g,使湖南砷污染稻田两年可溶砷下降45%,稻米增产15%,籽粒砷低于国标一半。在农业领域,特基拉芽孢杆菌表现出广谱抑菌与促生双重功效。菌株M408F10-3F8对12种病原菌和卵菌有强拮抗作用,黄瓜枯萎盆栽防效58%,与多菌灵相当,同时分泌IAA促生;菌株2-2a对大豆炭疽、黑斑、灰斑等叶部病害及根腐、立枯等土传病害兼具防效,且定殖速度快;菌株20Q9B-2-14对马铃薯软腐病菌抑制明显,为生防制剂添新选项。在水产养殖中,菌株ZSGD5与Bt-CO通过“异养硝化-好氧反硝化”低耗氧途径,把氨氮、亚硝酸盐迅速转为氮气逸出,5℃仍保持活性,可使斑节虾、花白鲢池塘氨氮下降60%,换水量减少三成。
BM液体培养基,全名Basal Mineral Liquid Medium,是微生物学界公认的“极简配方”。它只提供生命必需的矿物元素:K₂HPO₄ 1.0 g、KH₂PO₄ 1.0 g、MgSO₄·7H₂O 0.2 g、CaCl₂·2H₂O 0.02 g、Fe-EDTA 0.01 g,加蒸馏水至1 L,pH 6.5±0.1,无碳、无氮、无有机微量元素,因此也被称为“空白画布”。研究者可根据目标菌的代谢特点,精确添加单一碳源(如葡萄糖、苯甲酸、甲烷)、氮源(如NH₄Cl、NO₃⁻或尿素)及特定金属,实现代谢通路、降解基因或耐受机制的单变量研究。BM的高纯度与低背景使其成为环境微生物分离的优先。取河水或土壤浸提液,经0.22 μm过滤除菌后,取1 mL加入含BM的50 mL血清瓶,再投加目标污染物(如50 mg L⁻¹多环芳烃),28℃、150 r/min培养7天,即可富集到以该污染物为碳能源的降解菌群。继代3次后,稀释涂布于含BM的固体平板,菌落纯化率可达90%以上,极大减少杂菌干扰。此外,BM培养基在合成生物学中亦扮演重要角色。研究者可在BM中添加特定浓度的¹³C-葡萄糖或¹⁵N-NH₄Cl,实现全菌体同位素标记,为蛋白质组、代谢流分析提供干净背景;也可通过缺铁、缺锌的BM,研究金属调控蛋白的功能。科学家还在其基因组里插入耐盐基因,让它在西北盐碱地也能萌发,为弃荒滩涂夺回粮田。

解糖肠球菌(Enterococcus saccharolyticus)是一种革兰阳性、兼性厌氧的球菌,更早从英国稻草垫料中分离,模式菌株ATCC 43076被广用于API及VITEK®系统的质量控制。该菌因能发酵多种糖类产酸,故得名“解糖”,在分类学上与粪肠球菌、屎肠球菌并列,却极少携带典型毒力基因,安全性较高。近年研究发现,解糖肠球菌具有突出的益生潜力:它可在pH 2.5的胃酸和0.3%胆盐中保持90%存活,并分泌乳酸、乙酸等短链脂肪酸,迅速降低肠道pH,抑制沙门氏菌、大肠杆菌等致病菌的定植。体外试验还显示,该菌能黏附于Caco-2细胞单层,上调紧密连接蛋白ZO-1与Occludin的表达,增强肠屏障功能,减轻脂多糖诱导的炎症反应。在动物应用中,日粮添加10^7 CFU/g解糖肠球菌可显著提高断奶仔猪平均日增重8.7%,降低料重比6.3%,并减少腹泻率一半;其代谢产物还能促进双歧杆菌、乳酸菌等有益菌增殖,使结肠丁酸浓度升高30%,改善绒毛高度与隐窝深度比。此外,该菌对万古霉素敏感,不含vanA/vanB耐药操纵子,降低了基因横向转移风险。综上,解糖肠球菌凭借耐酸耐胆盐、产酸抑菌、增强屏障及促生长等多重功能,被视为替代抗生物质的潜力菌株,未来在婴幼儿食品、畜禽养殖及微生态制剂领域具有广阔前景。随后,细菌释放信号,诱导根部细胞分裂,三天鼓出乳白根瘤,像给根系挂上微型氮肥厂。中华耐冷黄杆菌
更妙的是,收获后大量根瘤遗落土中,氮素富集,连后续玉米都长得壮,像给土地存了活期存折。宛氏拟青霉
环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)是芽孢杆菌属的“多面手”,因菌落边缘呈规则的环状扩散而得名。菌体短杆、革兰氏阳性,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢,更适温度30–37 ℃,pH 6–9,广分布于土壤、淡水与海洋沉积物中。一、细胞壁“”该菌能产生几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶和纤维素酶,可分解菌细胞壁、植物残体和甲壳类废料,为碳循环打开“绿色通道”。实验室条件下,其几丁质酶粗酶液4 h内可降解蟹壳粉60 %,为甲壳素提取提供环保方案。二、生物防治与促生菌株BC-01分泌circulin A/B环肽,对立枯丝核菌、番茄青枯拉尔氏菌抑菌带宽达25 mm;同时产IAA 20 mg·L⁻¹,使玉米根长增30 %,吸磷量提22 %。大棚试验每亩滴灌200 g菌粉,黄瓜枯萎病指下降40 %,产量增12 %。三、工业酶宝库环状芽孢杆菌的碱性蛋白酶在pH 10、50 ℃下活性比较高,已用于无磷洗涤剂,血渍去污力提升30 %;耐热β-淀粉酶可将淀粉转化为麦芽糖,糖浆得率提高15 %,为食品与发酵工业提供绿色催化剂。四、医药与环保该菌能合成胞外多糖,具有良好的乳化和增稠性能,已用于面包保鲜,货架期延长3天。宛氏拟青霉