嗜碱芽孢杆菌(Bacillus alcalophilus)是芽孢杆菌属的“高碱”。菌体杆状、周生鞭毛,能在 pH 9–11 的极端碱性环境中旺盛生长,芽孢可耐 100 ℃ 沸水 30 min,是研究碱适应与工业酶的模式菌株。一、耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白(nhaA、nhaC)和碳酸酐酶,将胞内多余 Na⁺ 泵出并维持 pH 稳态;细胞壁肽聚糖富含 meso-二氨基庚二酸,膜脂分支化程度高,为高温高碱酶表达提供稳定平台。二、工业酶宝库其耐碱淀粉酶更适 pH 10、90 ℃,用于纺织退浆可省略中和步骤,节能 15 %;耐碱蛋白酶在 pH 11、40 ℃仍保持 90 % 活性,已列入无磷洗涤剂,血渍、奶渍去污力提升 30 %;耐碱木聚糖酶用于纸浆漂白,氯用量减少 30 %,降低可吸附有机卤化物(AOX)排放。三、农业应用菌株 AB-10 产 IAA 15 mg·L⁻¹,并溶磷 2.6 mg·L⁻¹,使玉米根系增 28 %,吸磷量提 18 %;与秸秆复配堆肥,24 h 堆温升至 65 ℃,纤维素降解率提高 30 %,堆肥周期缩短 7 d,杀灭病原菌和杂草种子效果明显。四、环境修复胞外多糖能吸附 Cd²⁺、Pb²⁺,吸附量分别达 50 mg·g⁻¹ 与 35 mg·g⁻¹;在 pH 9 的苏打盐碱土中定殖后,水稻产量增加 10 %,土壤交换性钠下降 15 %。它以甲醇、甲胺等一碳化合物为主食,却能把这些常被忽视的小分子变成高值产物。稻生掷孢酵母
德氏乳杆菌德氏亚种(Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii)是乳酸菌家族中更早被分离命名的“元老”之一,1901年即进入科学视野。菌体短杆、无芽孢、不运动,专性发酵葡萄糖产乳酸,更适生长温度42~45℃,可在pH 3.5的酸环境中存活,耐高温却畏冷,4℃即停止繁殖。基因组只1.8 Mb,代谢途径精简,却拥有完整的乳酸脱氢酶与寡肽转运系统,使其在蛋白质丰富的基质中快速产酸,抑制菌。工业上,它是酸奶、瑞士奶酪与保加利亚传统发酵乳的关键菌种,与嗜热链球菌协同可将牛乳在3小时内酸化至pH 4.2,形成细腻凝乳与特征性乙醛风味;同时分泌胞外多糖,赋予产品顺滑口感并延缓后酸化。近年研究还发现,其表面蛋白SlpA能黏附肠道上皮,诱导IL-10分泌,缓解小鼠结肠炎;热灭活菌体亦可通过启动树突细胞TLR2信号,增强肠道IgA应答,兼具益生与免疫调节潜力。随着合成生物学兴起,德氏乳杆菌德氏亚种被工程化改造为“活药工厂”,可在肠道内持续释放胰岛素样肽或白细胞介素,为糖尿病与炎症性肠病提供新型微生态治疗方案。粗糙脉孢菌如今生物公司把菌液封装成铝箔袋,春耕拌种即可,比化肥便宜三成,比粪肥干净百倍。

栗褐芽孢杆菌(Bacillus badius)是芽孢杆菌属的“暗色骑士”。菌落呈独特的栗褐色、边缘不规则,革兰氏阳性大杆菌,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢;更适温度30–37 ℃,pH 6.5–8.5,广分布于森林腐叶、草炭和动物肠道中。一、降解菌株产胞外酚氧化酶、漆酶和半纤维素酶,能把落叶、锯末中的木质-酚类物质分解成腐殖酸,7 d内稻草失重率35 %,腐殖酸含量提高1.8倍,为有机肥“褐化”提供天然菌种。二、防病促生栗褐芽孢杆菌分泌badius脂肽,对番茄青枯、辣椒疫霉抑菌带宽24 mm;同时产IAA 18 mg·L⁻¹,使玉米根长增28 %,吸磷量提棚试验亩施200 g菌粉,黄瓜枯萎病指降40 %,产量增12 %。三、工业酶潜力其漆酶更适pH 5、50 ℃,对染料活性黑KN-B脱色率3 h达85 %,已用于印染废水预处理;耐碱木聚糖酶在pH 9、55 ℃仍保持80 %活性,可助纸浆漂白减少氯用量30 %。四、土壤修复菌体胞外多糖能吸附Cd²⁺、Pb²⁺,吸附量分别达45 mg g⁻¹与30 mg g⁻¹;与生物炭混施,矿区污染土壤有效态镉下降50 %,蔬菜可食部镉低于国标。
BM液体培养基,全名Basal Mineral Liquid Medium,是微生物学界公认的“极简配方”。它只提供生命必需的矿物元素:K₂HPO₄ 1.0 g、KH₂PO₄ 1.0 g、MgSO₄·7H₂O 0.2 g、CaCl₂·2H₂O 0.02 g、Fe-EDTA 0.01 g,加蒸馏水至1 L,pH 6.5±0.1,无碳、无氮、无有机微量元素,因此也被称为“空白画布”。研究者可根据目标菌的代谢特点,精确添加单一碳源(如葡萄糖、苯甲酸、甲烷)、氮源(如NH₄Cl、NO₃⁻或尿素)及特定金属,实现代谢通路、降解基因或耐受机制的单变量研究。BM的高纯度与低背景使其成为环境微生物分离的优先。取河水或土壤浸提液,经0.22 μm过滤除菌后,取1 mL加入含BM的50 mL血清瓶,再投加目标污染物(如50 mg L⁻¹多环芳烃),28℃、150 r/min培养7天,即可富集到以该污染物为碳能源的降解菌群。继代3次后,稀释涂布于含BM的固体平板,菌落纯化率可达90%以上,极大减少杂菌干扰。此外,BM培养基在合成生物学中亦扮演重要角色。研究者可在BM中添加特定浓度的¹³C-葡萄糖或¹⁵N-NH₄Cl,实现全菌体同位素标记,为蛋白质组、代谢流分析提供干净背景;也可通过缺铁、缺锌的BM,研究金属调控蛋白的功能。温室试验显示,每亩用两百克菌粉拌基质,黄瓜枯萎率降四成,农药少打一半,果实仍青亮。

环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)是芽孢杆菌属的“多面手”,因菌落边缘呈规则的环状扩散而得名。菌体短杆、革兰氏阳性,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢,更适温度30–37 ℃,pH 6–9,广分布于土壤、淡水与海洋沉积物中。一、细胞壁“”该菌能产生几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶和纤维素酶,可分解菌细胞壁、植物残体和甲壳类废料,为碳循环打开“绿色通道”。实验室条件下,其几丁质酶粗酶液4 h内可降解蟹壳粉60 %,为甲壳素提取提供环保方案。二、生物防治与促生菌株BC-01分泌circulin A/B环肽,对立枯丝核菌、番茄青枯拉尔氏菌抑菌带宽达25 mm;同时产IAA 20 mg·L⁻¹,使玉米根长增30 %,吸磷量提22 %。大棚试验每亩滴灌200 g菌粉,黄瓜枯萎病指下降40 %,产量增12 %。三、工业酶宝库环状芽孢杆菌的碱性蛋白酶在pH 10、50 ℃下活性比较高,已用于无磷洗涤剂,血渍去污力提升30 %;耐热β-淀粉酶可将淀粉转化为麦芽糖,糖浆得率提高15 %,为食品与发酵工业提供绿色催化剂。四、医药与环保该菌能合成胞外多糖,具有良好的乳化和增稠性能,已用于面包保鲜,货架期延长3天。功能层面,巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌表现出“促生-抗病-解决”三合一特性。堆肥尿素芽孢杆菌
用长赖氨酸芽孢杆菌菌液灌根,番茄根结线虫侵染率下降42%,果实Vc含量提高12%,产量增8.3%。稻生掷孢酵母
赫氏埃希氏菌是深海热液口的“化学魔术师”,能在摄氏百度、千倍大气压的暗夜里,把硫化氢当早餐,把二氧化碳当点心来款待。它用氢硫还氧酶把剧毒硫化氢拆成电子与质子,驱动ATP合酶高速旋转,合成能量,再借逆三羧酸循环把无机碳织成有机糖,无需阳光,也能养活整片“黑烟囱”丛林。科学家搭乘深潜器采集菌体,发现其细胞膜含特殊醚键脂质,像给自身裹上耐高温的陶瓷瓦,蛋白质内部也布满离子键,仿佛微型钢铁骨架,才让它在沸水中依旧柔韧。实验室里,研究团队把它的固碳基因簇移植到工业大肠杆菌,使后者能在废气流里自养生长,产出的聚羟基脂肪酸酯可制可降解塑料,为碳中和提供新思路。小小赫氏埃希氏菌,用肉眼看不见的臂膀,托住地球深部与未来的绿色循环。稻生掷孢酵母