在PCR产物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的应用和优势,但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它们的特点:1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,尤其适合双链DNA的平末端、5'-突出末端或切口,从DNA链的3'-端释放5'-单磷酸核苷酸,产生单链DNA片段。-与Lambda核酸外切酶相比,ExoIII对具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶则对5'-磷酸化的双链DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP进行“3'dA加尾”,以提高连接效率。-这种方法通过在PCR产物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了与载体连接的可能性,从而提高克隆效率。3.**TOPO克隆载体**:-TOPO克隆载体含有共价连接的DNA拓扑异构酶I,可同时作为限制性内切酶和连接酶。-与传统PCR克隆载体相比,TOPO克隆载体具有更短的连接反应时间、更高的克隆效率以及更简单的分子克隆实验方案。综上所述,虽然Lambda核酸外切酶在特定情况下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每种酶都有其独特的特性和应用场景,选择合适的酶取决于具体的克隆需求和实验设计。Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,这使得Cas9与gRNA形成的复合物。Recombinant Mouse Periostin/OSF-2 Protein,His Tag
在质粒DNA提取过程中,确保DNA的完整性和活性至关重要,这通常涉及以下几个关键因素:1.**温和的裂解条件**:选择适当的裂解方法对于保持DNA的完整性至关重要。对于大于15kb的质粒DNA,应采用温和的裂解方法,如将细菌悬浮于等渗的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破坏细胞壁和细胞膜,以减少对质粒DNA的机械剪切力,从而保护其完整性。2.**避免过度裂解**:在质粒提取过程中,并非裂解时间越长越好。过长的裂解时间可能会造成基因组DNA片段的污染,影响质粒的纯度。3.**适当的洗涤和洗脱**:在纯化过程中,适当的洗涤可以去除蛋白质和其他杂质,但过度洗涤可能会导致DNA的损失。洗脱步骤中,确保洗脱液完全浸润柱膜,以保证结合在柱膜上的质粒得以充分洗脱,避免因洗脱体积过小而影响质粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取过程中,添加核酸酶抑制剂可以防止DNA被核酸酶降解。同时,避免长时间将DNA暴露在室温下,以及避免多次冻融循环,这些都有助于保护DNA的完整性。5.**低温操作**:尽量在低温条件下进行提取操作,以减少核酸酶的活性,从而保护DNA的完整性。
T7EndonucleaseI(T7EI)是一种特殊的DNA内切酶,具有以下特点:1.**识别错配DNA**:T7EI能够识别并切割不完全配对的DNA、十字型结构DNA、Holliday结构或交叉DNA以及异源双链DNA。2.**切割位点**:T7EI切割错配位点5'端的、第二或第三个磷酸二酯键。3.**灵敏度**:T7EI对错配DNA的识别非常灵敏,能够检测并切割单碱基和多碱基的错配。4.**应用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因编辑技术导致的基因突变的鉴定。它通过识别错配DNA来帮助鉴定基因编辑是否成功以及是否有非目标效应。5.**直接电泳检测**:T7EI的产物可以直接通过电泳进行检测,这使得它在实验操作中更为方便。6.**来源**:T7EI来源于大肠杆菌菌株,是一种麦芽糖结合蛋白(MBP)和T7核酸内切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:尽管T7EI在商业上使用时成本较高,但它在大规模样本测试中,尤其是在基因突变鉴定方面,提供了一种有效的筛选方法。8.**特殊注意事项**:T7EI能够识别长度大于或等于2bp的插入、缺失或突变导致的错配DNA,但不能识别1bp的插入、缺失或突变。这些特点使得T7EndonucleaseI成为基因突变鉴定中一个非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因编辑技术的应用中。
在比较BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶对于复杂DNA片段扩增的适用性时,以下是一些关键点:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高热稳定性和扩增效率而被应用于常规PCR。它扩增速度为30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,无校正功能,易产生错配碱基。-对于结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等,TaqPlus可以用于扩增,能有效地扩增10kb以下的片段。-有产品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通过基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具备更强大的扩增性能,适合扩增高度复杂的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高适温度,能够适应更加苛刻的扩增条件,同时消除DNA二级结构,因而能够准确并且均匀地扩增全基因组序列。-BstDNA聚合酶大片段能够优先扩增短片段的DNA,并且能够确保扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有的遗传位点。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,扩增速度高达10秒/kb,扩增目的片段长达13kb,具有极强的扩增效率的模板适应性,非常适合复杂模板的高保真扩增。
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,简称λExonuclease)是一种具有特定特性和应用的酶,以下是其主要特点和应用:1.**特异性作用**:λExonuclease是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**酶切活性**:对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**嗜磷酸性**:该酶具有非常强的嗜磷酸性,磷酸化的核酸链与非磷酸化的核酸链的切割效率相差达200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一种具有高度持续性的碱性核酸外切酶,可以连续地将核酸切割成为单个碱基,切割比较高速率可以达到1000nt/S。5.**应用领域**:-生成单链PCR产物用于DNA测序。-DNA单链构象多态性(SSCP)分析。-滚环扩增。-从双链DNA片段生成单链DNA。-PCR产物的克隆。-质粒制备净化。6.**酶活性定义**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37ºCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。多泛素化的靶蛋白被26S蛋白酶体识别。26S蛋白酶体由一个20S颗粒和两个19S调节颗粒组成。Recombinant Human PSA/Kallikrein-3
在泛素化过程中,首先泛素激起酶E1(Uba1或其他)在ATP的存在下激起泛素分子,形成E1-泛素硫酯中间体。Recombinant Mouse Periostin/OSF-2 Protein,His Tag
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸内切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修复酶,但它们之间存在一些关键的区别:1.**活性类型**:-**核酸内切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以释放受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。-**核酸内切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能够切割DNA磷二酯骨架在AP位点处,但不具备δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**识别和切除的受损碱基**:-**核酸内切酶VIII**:可以识别并切除包括尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲在内的多种受损碱基。-**核酸内切酶III**:主要识别和切除氧化性损伤的嘌呤碱基,如8-氧鸟嘌呤。3.**裂解酶活性**:-**核酸内切酶VIII**:具有β和δ裂解酶活性,而**核酸内切酶III**具有β裂解酶活性。这些区别决定了它们在DNA损伤修复中的作用和应用范围。
嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一种热稳定的酶,它在高温下(55-65°C)仍然保持活性,这使得它在分子生物学实验中非常有用,尤其是在需要高温反应的实验中,如热循环扩增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**热稳定性**:BstDNAPolymeraseI在高温下具有较高的稳定性,适用于高温反应的实验,如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:这种酶具有3'到5'外切酶活性,能够切除DNA末端上的非特异性引物和杂交DNA,使其成为等温扩增应用的理想酶。3.**耐盐性**:BstDNAPolymeraseI在高盐条件下仍能保持稳...