CDK5 Substrate (Phospho-Thr3)

EndoS糖苷内切酶在ADCs制备中的具体应用步骤，根据上海药物研究所的研究，可以概括为以下几个关键环节：1.**筛选糖底物和糖苷内切酶**：研究人员筛选了一系列糖底物和糖苷内切酶，发现Endo-S2酶能够将二糖底物LacNAc转移至去糖抗体N297位糖基化位点，且LacNAc半乳糖6号位唾液酸化修饰不影响Endo-S2的转糖基化活性。2.**抗体糖基化改造**：利用Endo-S2和LacNAc的组合，直接实现野生型抗体的糖基化改造。Endo-S2对多样化LacNAc修饰的兼容性，可以高效获得功能修饰的糖工程抗体。3.**设计合成药物-连接子复合物**：研究人员设计并合成了LacNAc-linker-drug复合物结构，这是实现定点ADC化合物“一步”组装的关键。4.**“一步”定点偶联**：通过Endo-S2的催化作用，将小分子细胞毒药物通过特定的糖链结构直接定点连接到抗体的糖基化位点，简化了ADCs的制备流程。5.**评价和测试**：对获得的糖链定点ADC化合物进行结构均一性、亲水性、体外稳定性及体外活性的测试。测试结果显示，这些化合物具有非常好的结构均一性（DAR=2）、亲水性和体外稳定性，并且在体外具有强大的瘤抑制活性。

EndoH糖苷内切酶H在实验中的特异性和效率通常通过以下几个方面来确定：1.**特异性识别**：EndoH能够特异性地识别并切割高甘露糖型N-连接糖链，这些糖链通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**切割位点**：EndoH识别并切割壳二糖结构中的β-1,4-糖苷键连接的甘露糖型结构糖链，但不能切割复杂型糖链糖蛋白。3.**酶活性测试**：通过使用标准糖蛋白底物进行酶活性测试，可以确定EndoH的活性和效率。4.**纯化效果**：EndoH的纯度可大于95%，这有助于确保实验中酶的高效性。5.**比较分析**：与其他去糖基化酶（如PNGaseF）进行比较分析，可以评估EndoH的特异性和效率。6.**应用效果**：EndoH用于基于DNA测序的荧光辅助糖电泳(DSA-FACE)分析核糖核酸酶B(ribonucleaseB,RNaseB)的糖基结构，可以比较不同酶的糖基切割功能。7.**酶切时间**：EndoH的酶切时间通常为1-3小时，这有助于评估酶的效率。8.**产品信息**：通过查看产品信息，包括产品编号、规格和目录价，可以了解EndoH的商业可用性和应用范围。通过这些方法，研究人员可以确保EndoH在糖链分析中的特异性和效率，从而获得准确的糖链结构信息。Recombinant SARS-COV-2 Spike S1 NTD (His-Flag Tag)E2酶接收来自E1的激起泛素，并在E3酶的协助下将泛素分子转移到靶蛋白上。

使用PreScissionProtease进行蛋白质切割时，为保证高纯度和高活性，需要考虑以下关键因素：1.**特异性切割位点**：确保融合蛋白中包含PreScissionProtease特异性识别的序列，以实现精确切割。2.**酶与底物的比例**：适当比例的酶量对于高效切割至关重要，过多或过少的酶都可能影响切割效率和纯度。3.**反应条件**：包括温度、pH和反应时间等，这些条件需要优化以确保酶的活性和选择性。通常，PreScissionProtease在4°C下进行酶切。4.**缓冲液兼容性**：使用与PreScissionProtease兼容的缓冲液，避免使用可能抑制酶活性的离子或化学物质。5.**蛋白浓度**：确保融合蛋白有足够的浓度，以提高切割效率和减少样品损失。6.**酶切后的分离**：切割后，需要有效分离目的蛋白和切割下来的标签，通常利用亲和层析等方法。7.**避免蛋白降解**：在实验过程中添加蛋白酶抑制剂，以防止蛋白降解酶对目的蛋白的降解。8.**避免蛋白质聚集**：在切割过程中，应避免条件导致蛋白质聚集或沉淀，这可能会影响纯度和活性。9.**避免氧化**：在蛋白质处理过程中，添加抗氧化剂如DTT或TCEP，以防止半胱氨酸残基的氧化。10.**清洁的实验环境**：确保实验器材和环境的清洁，避免微生物污染和核酸污染。

PreScissionProtease（PSP）在去除融合蛋白标签时，对目的蛋白的纯度和活性的影响通常是积极的，具体表现在以下几个方面：1.**小化污染**：由于PSP具有高度的特异性，它在特定的肽键处切割，从而减少了非特异性切割可能导致的蛋白质片段，这有助于保持目的蛋白的纯度。2.**减少蛋白质修饰**：PSP的特异性切割有助于避免在切割过程中对目的蛋白引入额外的修饰，如磷酸化或糖基化，这些修饰可能会影响蛋白质的活性和稳定性。3.**保持活性**：如果融合蛋白标签的设计和切割位点选择得当，PSP切割后的目的蛋白通常能够保持其原有的生物活性。切割位点通常位于标签和目的蛋白之间，这样切割后不会在目的蛋白上留下额外的氨基酸，从而减少了对蛋白质结构和功能的影响。4.**提高纯度**：PSP切割后，可以通过亲和层析等方法将标签、PSP以及未切割的融合蛋白分离，从而获得高纯度的目的蛋白。5.**便于后续分析**：去除标签后的目的蛋白更易于进行后续的质谱分析、晶体学研究或其他生物化学分析，因为去除了可能干扰分析的标签部分。6.**稳定性**：在某些情况下，融合蛋白的标签可能有助于稳定目的蛋白的构象，因此在去除标签后，需要适当处理以维持目的蛋白的稳定性。激发的泛素被转移到泛素结合酶E2的活性位点半胱氨酸残基上，形成E2-泛素硫酯中间体。

IdeSProtease的分子改造技术主要通过以下几个方面提高其稳定性和比活性：1.**定向进化**：利用定向进化方法，通过多轮的突变和筛选，获得具有改善特性的酶变体。定向进化不依赖于大规模突变文库的构建，而是通过定点突变操作，显著提高酶分子的稳定性。2.**半理性设计与理性设计**：结合半理性设计和理性设计的方法，通过计算模拟和结构分析，对酶的三维结构进行优化，以提高其在各种环境条件下的稳定性。3.**糖基化修饰**：作为一种新的酶分子稳定性改造技术，糖基化可以提高酶的稳定性，防止酶在逆境中的失活，从而提高其在实际应用中的催化活性。4.**消除蛋白质中的不稳定性弱点**：通过分析蛋白质结构中的稳定性弱点，进行定点突变，以增强蛋白质的整体稳定性。5.**提高比活性**：通过分子改造，提高IdeSProtease的比活性，使其在更低的浓度下就能有效地催化反应，从而提高整体的催化效率。6.**增加底物特异性**：改造后的IdeSProtease除了可以切割人IgG1~4、猴、羊、兔IgG外，还对小鼠IgG2a、IgG3具有特异性切割活性。。

Cas12a不仅具有顺式切割活性，还具备独特的反式切割活性，这使得它能够无差别地裂解附近的单链DNA。CDK5 Substrate (Phospho-Thr3)

在ADCs（抗体药物偶联物）的制备过程中，确保药物的稳定性和生物活性是至关重要的。以下是几个关键步骤和技术要点：1.**药物抗体比（DAR）的控制**：DAR是影响ADC稳定性的关键因素。通过控制DAR和药物负荷分布，可以促进ADC的稳定性。DAR值在2-4之间通常被认为是好的选择，但后面的DAR值需要通过稳定性试验、体内有效性和药代动力学共同决定。2.**连接子的选择**：连接子在化学过程中、血浆循环以及产品储存过程中的稳定性非常关键。连接子的选择决定了抗体药物的DAR，并且连接子的稳定性影响着ADC的整体稳定性。3.**有效载荷的选择**：有效载荷对ADC的毒性和生物活性至关重要。选择具有高度细胞毒性且能在靶细胞内有效释放的有效载荷是必要的。同时，有效载荷及其代谢形式决定了ADC分子的毒性。4.**制剂配方的优化**：ADC的制剂配方需要考虑抗体、连接子和有效载荷的稳定性和特性。pH值、缓冲液、离子强度、表面活性剂和抗氧化剂等都可能影响ADC的稳定性。5.**避免聚集**：ADC的聚集倾向比单独的抗体更高，因此需要采取措施减少聚集，如使用非离子表面活性剂和优化冻干工艺。