大肠杆菌的基因通常由4个字母的首字母缩写来命名,这些首字母缩略词源自它们的功能(已知时)并以斜体显示。例如,recA是根据它在同源重组中的作用加上字母A来命名的。功能相关基因被命名recB,recC,recD等等。蛋白质以大写首字母缩写命名,例如RecA、RecB等。当人类的基因组大肠杆菌测序完成后,所有基因在基因组中按其顺序编号(或多或少),并用b编号缩写,如b2819(=recD)。“b”的名字是由弗雷德·布拉特纳(FredBlattner)命名的,他领导了基因组测序工作。是用另一种大肠杆菌菌株W3110的序列引入的,该菌株在日本进行了测序,因此使用的编号以JW开头(JapaneseW3110),例如JW2787(=recD)。因此,recD=b2819=JW2787。然而,请注意,大多数数据库都有自己的编号系统,例如生态基因数据库将EG10826用于recD。然后,ECK编号专门用于大肠杆菌K-12MG1655菌株的等位基因。基因及其同义词的完整列表可以从数据库中获得,如EcoGene或Uniprot。枯草芽孢杆菌不仅在饲料中应用比较普遍,在污水处理及生物肥发酵或发酵床制作中应用也相当普遍。深海微小杆菌菌株
大肠杆菌表达系统在现代的生物技术方面的应用:利用大肠杆菌表达系统可溶性表达人乳t瘤病毒HPV18蛋白,经过纯化和重组过程获得HPV18病毒样颗粒,研究其免疫原性和诱发中和抗体生成的水平。把碱性磷酸脂酶基因phoA信号肽的疏水区置换为多聚Leu残基,明显提高分泌效率,这一结果为天然信号肽优化改造的设计提供了很好的参考依据。膜蛋白基因在大肠杆菌中表达的技术逐渐成为研究的热点领域。外源蛋白质在菌体表面表达的优点是大肠杆菌可用于制备疫苗,进行生物催化和作为探针筛选药物。易变链霉菌菌种金黄色葡萄球,编号为ATCC6538。
大肠杆菌属和沙门氏菌属大约1、02亿年前分化(可信区间:57–176mya),这与它们宿主的分化是一致的:前者见于哺乳动物,后者见于鸟类和爬行动物。接下来是一个大肠杆菌属祖先分成五个物种(E.albertii,E.coli,E.fergusonii,E.hermannii,andE.vulneris、)。大肠杆菌的然后一个祖先是在两千万到三千万年前分裂的。1988年,理查德.兰斯基(RichardLenski)开始利用大肠杆菌进行长期进化实验,在实验室里直接观察了6.5万多代大肠杆菌的基因组进化。[33]例如,大肠杆菌通常不具有以柠檬酸盐作为碳源有氧生长的能力,而柠檬酸盐被用作区分的诊断标准,用以将大肠杆菌与其他密切相关的细菌(如沙门氏菌)区分开来。在这个实验中,一群大肠杆菌出人意料地进化出有氧代谢柠檬酸盐的能力,这是一个具有微生物物种形成特征的重大进化转变。
保存条件斜面、穿刺菌和冻干粉可常温运输,但应在4-10度长期保存。甘油菌可常温运输,但应在-80度长期保存。微生物菌种应保存于低温、清洁和干燥的地方,室温放置时间过长会导致菌种衰退。
冻干管的开启方法:方法一:将冻干粉甩至底部圆球位置,然后用70%的酒精脱脂棉球擦净冻干管,将冻干管的前列(注意不是圆球端)放在火焰上加热。然后迅速滴几滴无菌水至加热处,此时冻干管的前列会自动破开。然后用镊子轻轻敲下冻干管前列,并将冻干管开口处在火焰上加热灭菌一下,并且保持下面的菌种菌种活化步骤在火焰旁操作。然后逐渐敲开冻干管,直至适当位置。(敲开位置以可以很好注入无菌水以及吸取混匀后的液体为准)直接敲开法。方法二:首先将冻干粉甩至底部圆球位置,然后用70%的酒精脱脂棉球擦净冻干管,将冻干管的前列(注意不是圆球端)放在火焰稍微加热灭菌。然后直接用大镊子敲打前列,敲开后将破口处在火焰上加热灭菌一下,并且保持下面的菌种菌种活化步骤在火焰旁操作。然后逐渐敲开冻干管,直至适当位置。(敲开位置以可以很好注入无菌水以及吸取混匀后的液体为准)。 金黄色葡萄球在自然界中无处不在,空气、水、灰尘及人和动物的排泄物中都可找到。
使用较低温甘油保存法保存铜绿假单胞菌时,若采用1.5毫升离心管保存菌种,移种时要特别注意无菌操作,尽量采用螺口的带盖冷冻管保存菌种,以减少污染的机会。采用螺口的带盖冷冻管的方法保存肠杆菌科的细菌及革兰阳性需氧杆菌如炭疽芽孢杆菌、腊样芽孢杆菌等均取得良好的保存效果。铜绿假单胞菌保存低温存法,简单保存法,将琼脂斜面孢子培养物、菌丝悬浮液以及由麸皮、大米、小米等谷物原料制成的孢子培养物置于4摄氏度冰箱保存,保存时间不超过1~2个月,若将谷物原料制备的孢子瓶抽真空并在棉塞上浸蜡,以隔绝外界空气和水汽,保持时间可达3~4个月。铜绿假单胞菌菌种不能在4-10度条件下储存,容易死亡。易变链霉菌菌种
枯草芽孢杆菌能迅速抑制其它病原微生物生存,起到“贴身”保护植物,确保植物健康成长的作用。深海微小杆菌菌株
SHBCCD73661巴氏醋杆菌SHBCCD73661AcetobacterpasteurianusSHBCCD73662植物乳杆菌SHBCCD73662=ATCC8014=BCRC10357=CCUG11253=CCUG9289=CGMCC1.1856=CIPA159=DSM20205=JCM1057=JCM665LactobacillusplantarumAssayofbiotinandnicotinicacid,aminoacidSHBCCD73663干酪乳杆菌SHBCCD73663LactobacilluscaseiSHBCCD73664鼠李糖乳杆菌SHBCCD73664LactobacillusrhamnosusSHBCCD73665巴氏醋杆菌SHBCCD73665AcetobacterpasteurianusSHBCCD73666巴氏醋杆菌SHBCCD73666AcetobacterpasteurianusSHBCCD73667巴氏醋杆菌SHBCCD73667AcetobacterpasteurianusSHBCCD73668小肠肠球菌SHBCCD73668=ATCC8043=ATCC9790=BCRC11054=BCRC12496=BCRC80016=CCM2423=CCUG1332=CCUG18659=CCUG19Enterococcushirae模式菌株SHBCCD73669植物乳杆菌SHBCCD73669Lactobacillusplantarum生产表飞鸣SHBCCD73670乳酸乳球菌乳亚种SHBCCD73670L肠膜明串珠菌葡聚糖亚种SHBCCD73671L柠檬色明串珠菌SHBCCD73672LeuconostoccitreumSHBCCD73673布氏乳杆菌SHBCCD73673Lactobacillusbuchneri深海微小杆菌菌株
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