RNA提取醇沉淀不是越多就越好。有些实验方案会推荐,在异丙醇沉淀后,用乙醇沉淀两次。实际上,任何提取实验,都会在纯度和得率这一对矛盾中取舍。醇沉淀会将脂溶性杂质去掉,但部分非脂溶性的杂质依然会连同RNA一起被沉淀下来。因此,多整几次,并不会让RNA的纯度翻倍,反而还会有降低得率的风险。一般情况下,异丙醇和乙醇各沉淀一次即可。但是,倘若预计RNA浓度很低,那就只能放弃纯度,在低温沉淀数小时,以换来较高的得率。围绕DEPC的玄学。许多实验方案会推荐使用0.1% DEPC处理RNA相关用水,以灭活RNase。这一点是要肯定的。不过,在使用DEPC的过程中,又充斥着一些玄学。高压灭菌后的DEPC水,会有一股“香甜”的味道。许多人会以为那是残留的DEPC而不敢用。实际上,这只是DEPC分解成CO2和乙醇后,产生的一些挥发性酯类副产物。RNase主要来自样品的细胞。济南RNA提取试剂厂家供应
RNA 提取关键点病菌 RNA 在提取后也仍然具有传染性,在提取时,实验人员需要佩戴口罩和手套等各种防护装备,以防实验室污染。而有种「自动灭活」的方法,在更加便利的同时,也能更好的保护实验人员的安全。许多样品中含有高水平的 RNase,这种酶也会加速 RNA 的降解。为了使这种酶对降解的影响较小化,较好在采集时就稳定好样本中的 RNA。这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。比如可以通过 TRIzol®、RNA 裂解缓冲液等使 RNase 失活,然后再处理样本。另外,再采集样本之后马上加入 DNA/RNA Shield,可以快速降解掉 RNase 等蛋白物质。当然,DNA/RNA Shield 也会保证取样时微生物基因多样性不会发生改变。太原正规RNA提取试剂推荐厂家该EpiQuik™总RNA提取试剂盒提供了一种快速,简单,经济有效的方法。
经典Trizol法并不能获得总RNA:这个事实可能会刷不少新手甚至老手的三观,但确有实验支持:经典Trizol法会选择性丢失低GC比的miRNA。这一点,源自一则作者自撤稿的故事。V. Narry Kim是韩国鼎鼎大名的美女科学家,专做RNA相关的研究,包括miRNA。几年前她们组发现一个奇怪的“现象”,即贴壁细胞在消化之后,会有一些miRNA的丰度突然降低,看起来好像是被快速“降解”掉了,并据此写了一篇文章发到Molecular Cell上。但很快她们就发现,这个“现象”难以重复:如果用Trizol做实验,就一定是阳性结果,而用试剂盒提RNA,就重复不出来。难道是号称能提总RNA的Trizol方案出了问题?确实如此。经进一步实验后发现,经典的Trizol方案会使得低GC比的miRNA丢失。
酵母RNA的提取方法:浓盐法。酵母菌外层是厚达 1.2µm 的细胞壁,其化学成分 是葡聚糖(30-40%)和甘露聚糖(30%),此外,脂类8.5-13.5%,蛋白质 6-8%,还含有几丁质,酵母菌的葡聚糖,分子是为 240000 道尔顿,是一种分枝聚合物,葡聚糖与甘露糖之间由蛋白质维系起来。近 10% 的甘露聚糖的侧链通过磷酸二酯键与磷酸边接,所有这些连接方式都使得酵母提取物首要的也是关键的是如何破坏细胞壁。破壁方法有自溶破壁、酶法破壁等多种方法,而用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞的通透性,就可以使核酸从细胞内释放出来。由于 RNA 钠盐易溶于水, 在含盐的菌体溶液中, RNA 有较高的溶解度, 这样, 通过控制温度使蛋白质变性沉淀,通过离心将 RNA 及蛋白质和脱核酵母菌体分离, 从而达到提取之目的。其中食盐起到自溶促进剂,以及防腐与脱臭的作用。RNA在260nm波长处有较大的吸收峰。
RNA提取注意事项:使用时一定要根据自己的实验需要购买**提取试剂盒, 如果不是**试剂盒,或许能提出RNA,但不能确保其质量以及完整性,会影响RT-PCR、Northern blot、Dot blot、Real time RT PCR、芯片分析、polyA 筛选、体外翻译、RNase 保护分析、分子克隆等后续实验的结果。当前提取效果好的是RNA提取试剂盒,但其售价较高,单次实验费用花费太大,对精度要求不高的实验没有必要购买,当然还有其它的进口试剂盒,但是均存在价格高、订货周期长的问题(如果碰上国内无货的时候,要从国外发货,会等很长一段时间)。普通的提取实验用国产的试剂盒就足以,价格不高,基本上各地均有现货(国内生产的试剂盒中销售面比较广的一种)等,其价格比进口试剂盒要便宜许多,且效果还不错,性价比还可以。加入氯仿离心后,裂解液分层成水相和有机相。天津正规RNA提取试剂厂家供应
使用时一定要根据自己的实验需要购买**提取试剂盒, 如果不是**试剂盒。济南RNA提取试剂厂家供应
RNA提取真正需要注意的要点:你的植物组织样本采样、保存正常吗?组织裂解充分了吗?组织起始量是否过大?起始量过大的话,他们得带进去多少RNase呀,导致裂解液不能充分压制内源性的RNase,失败就在预料之中!你的细胞活性好吗?细胞都到衰亡期了,你提什么RNA呀;细胞加的那么多,破壁不充分,怎么裂解的好呢,他们本身得带进去多少内源性RNase污染呀!转移液体时吸到沉淀了吗?吸水相时碰到中间层了吗?乙醇干燥净了吗?裂解样本的过程是重中之重液氮研磨(手工):要先加液氮预冷一下研钵,然后研磨,研磨过程要保证研钵中一直有少量液氮,研磨完成一个样本后,直接加入裂解液涡旋震荡后放常温,或者直接丢到液氮中,全部研磨后一起加裂解液。液氮研磨(研磨仪):研磨模块丢到液氮中预冷,直到没有气泡冒出视为预冷完毕。在2ml圆底离心管(不需要无酶管,液氮研磨中不破裂就好)中加入5mm钢珠一粒,放进样品,投入液氮中预冷。把所有预冷好的离心管**研磨模块中,放进研磨机震荡20-30秒。完成后马上加裂解液,涡旋。济南RNA提取试剂厂家供应
DNA和RNA的鉴别染色:利用吖啶橙的变色特性可鉴别DNA和RNA。吖啶橙作为一种荧光染料已被用于染色固定,非固定细胞核酸,或作溶酶体的一种标记。观察死亡细胞荧光变色性变化以及区别分裂细胞和静止细胞群体。虽然测定DNA和RNA含量时较难获得好的重复性结果,但该方法已被许多实验室普遍采用。RNA是核糖核酸,DNA是脱氧核酸。区别:溶解性:都溶于水而不溶于乙醇,因此,常用乙醇来沉淀溶液中的DNA和RNA。DNA溶于苯酚而RNA不溶,故可用苯酚来沉淀RNA。再采集样本之后马上加入 DNA/RNA Shield,可以快速降解掉 RNase 等蛋白物质。石家庄正规RNA提取试剂单价病毒RNA提取试剂盒可...