疏水性层析蛋白纯化系统是利用盐-水体系中样品分子的疏水基团和层析介质的疏水配基之间疏水力的不同而进行分离的一种层析方法。疏水性层析蛋白纯化系统正逐渐成为分离纯化蛋白质等生物工程产品有效的技术之一。单抗可以用来鉴定蛋白质的表达情况（如目的蛋白的相对表达量、分子量）、在细胞中的定位以及其它特性。疏水性层析蛋白纯化系统的优势在于：（1）N-端的疏水性层析与细菌的转录翻译机制兼容，有利于蛋白表达；（2）采用IMAC（固定化金属离子亲合层析）纯化融合蛋白操作更加简便；（3）对目的蛋白本身特性几乎没有影响，不会改变目的蛋白本身的可溶性和生物学功能；（4）非常小，一般不影响蛋白质的功能，且在融合蛋白结晶后对蛋白的结构没有影响；（5）免疫原性相对较低，可将纯化的蛋白直接注射入动物体内进行免疫并制备抗体；（6）与其它亲和标签构建成双亲和标签，并可应用于多种表达系统，纯化的条件温和；融合蛋白的适用范围也较广，既可以在非离子型表面活性剂存在的条件下纯化，也可以在变性条件下进行纯化。前者通常用来纯化疏水性强的目的蛋白，而后者则通常纯化包涵体蛋白。 用层析仪纯化蛋白前要过滤蛋白吗？常州一站式蛋白纯化服务商
影响盐析的因素有：（1）温度：除对温度敏感的蛋白质在低温（4度）操作外，一般可在室温中进行。一般温度低蛋白质溶介度降低。但有的蛋白质（如血红蛋白、肌红蛋白、清蛋白）在较高的温度（25度）比0度时溶解度低，更容易盐析。（2）pH值：大多数蛋白质在等电点时在浓盐溶液中的溶介度比较低。（3）蛋白质浓度：蛋白质浓度高时，欲分离的蛋白质常常夹杂着其他蛋白质地一起沉淀出来（共沉现象）。因此在盐析前血清要加等量生理盐水稀释，使蛋白质含量在2.5-3.0%。
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离子交换色谱这是在所有的蛋白纯化与浓缩方法中***方法[4,51。基于蛋白与离子交换树脂间的相互电荷作用，通过选择不同的缓冲液，同-种蛋白既可以和阴离子交换树脂(能结合带负电荷的分子)结合，也可以和阳高子交换树脂结合。树脂所用的带电基团有四种:二乙基氨基乙基用于弱的阴离子交换树脂;羧甲基用于弱的阳离子交换树脂;季铵用于强阴离子交换树脂;甲基磺酸酯用于强阳离子交换树脂。蛋白质由氨基酸组成，氨基酸在不同的pH环境中所带总电荷不同。大多数蛋白在生理pH(pH6--8)下带负电荷，需用阴离子交换柱纯化，极端的pH下蛋白会变性失活.应尽量避免。由于在某个特定的pH下不同的蛋白所带电荷数不同，与树脂的结合力也不同，随着缓冲液中盐浓度的增加或pH的变化，蛋白按结合力的强弱被依次洗脱。在工业化生产中更多地是改变盐浓度而不是去改变pH值，因为前者更容易控制。在实验室中几乎总是用盐浓度梯度去洗脱离子交换柱,利用泵的辅助可以使流入柱的缓冲液中盐浓度平稳地上升,当离子强度能够中和蛋白的电荷时,蛋白就被从柱上洗脱下来。但在工业生产中盐浓度很难精确控制，所以常用分步洗脱而不足连续升高的盐梯度。与排阻层析相比，离子交换特异性更好。
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亲和层析亲和层析基于目的蛋白与固相化的配基特异结合而滞留，其他杂蛋白会流过柱子。本方法存在的问题是:单抗非常昂贵，而且也需先纯化;单抗与目的蛋白结合力太强.要用苛刻的条件来洗脱,这会使目的蛋白失活并破坏单抗;混合物中的其他蛋白如蛋白酶也可能破坏抗体或与它们非特异结合;某些单抗也会在纯化过程中从树脂上解离下来混入产物中，也需要从终产物中去除。亲和柱通常在纯化过程的后期应用,此时标本体积已縮小，大部分的杂质已经去除。谷胱甘肽S-转移酶(Glutathiones-transferase,GST)是**常用的亲和层析纯化标签之-，带有此标签的重组蛋白可用交联谷胱甘肽的层析介质纯化，但本方法有以下缺点:首先，蛋白上的GST必须能合适地折叠,形成与谷胱甘肽结合的空间结构才能用此方法纯化;其次，GST标签多达220个氨基酸,如此大的标签可能会影响表达蛋白的可溶性,使形成包涵体，这会破坏蛋白的天然结构，难于进行结构分析,有时即便纯化后再酶切去除GST标签也不一定能解决问题。
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凝胶过滤层析
凝胶过滤（也叫排阻层析或分子筛）是一种根据分子大小从混合物中分离蛋白质的方法。不同蛋白的形状及分子大小存在差异，在混合物通过含有填充颗粒的凝胶过滤层析柱时，由于各种蛋白的分子大小不同，扩散进入特定大小孔径颗粒内的能力也各异，大的蛋白分子会被先洗脱出来，分子越小，越晚洗脱，从而达到分离蛋白的目的。一般来说，凝胶过滤层析柱越细、越长纯化的效果越好。凝
胶过滤层析详细介绍
凝胶过滤层析所能纯化的蛋白分子量范围很宽，纯化过程中也不需要能引起蛋白变性的有机溶剂。缺点是所用树脂有轻度的亲水性，电荷密度较高的蛋白容易吸附在上面，不适宜纯化电荷密度较高的蛋白。 常州一站式蛋白纯化服务商
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