约50%的类风湿关节炎(RA)患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答,但缺乏可预测患者应答的预后标志物。Arthritis and Rheumatology上发表的一项研究,对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异,发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外,体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明,肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或消失可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者,16名对甲氨蝶呤改善不应答;②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异;③不应答患者的菌群多样性更高,厚壁菌门/拟杆菌门比值增加,广古菌门丰度升高,MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集;④在另外21名新发RA患者中,基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答(AUC=0.84);⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤,培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。肠道菌群检测的临床指导意义。上海神经类疾病菌群检测预测疾病
过去的研究已鉴定出多个类风湿关节炎(RA)相关的基因突变,而肠道菌群是RA的环境风险因素之一。The Lancet Rheumatology上发表的一项横断面研究,在非RA患者中发现,并在RA高危受试者中验证,普氏菌属与RA的遗传风险明显相关,普氏菌属还与RA高危受试者的临床前期症状相关。①纳入1650名非RA双胞胎,基于233个GWAS鉴定出的RA相关SNP,评估受试者的RA多基因风险评分(PRS);②在6776名受试者(包括2686名RA患者)中,基于逻辑回归对RAPRS进行验证;③对受试者的粪便菌群进行测序,分析菌群与RAPRS的关联;④在非RA受试者中,普氏菌属与RAPRS呈明显正相关,在RA高危受试者(RA患者的直系亲属)中也存在这种关联;⑤另外,包括普氏菌属在内的7个菌属与RA的临床前期症状(ACPA或RF阳性等)相关。安徽粪便菌群检测预测疾病肠道菌群决定您的心理健康?
GenomeMedicine近期发表的文章,通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析,发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征,且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变,效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来改善的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究,收集64份粪便样本进行宏基因组测序;②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素,其次是疾病活动指数——MCII状态,且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异;③基线检查和随访中,取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高;④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变,被证明是非常有效的,证明了肠道菌群的潜在临床实用性。
AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对比了强直性脊柱炎患者与健康人的粪便菌群组成差异,并发现患者粪便中潜在的交叉反应性细菌表位的富集,同时,抗TNF改善与患者菌群的恢复、交叉性细菌表位的减少相关。①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。肠道菌群检测有重大意义。
药物微生物组学是一门新兴学科,关注药物与菌群之间的复杂互作。Nature Reviews Rheumatology上发表的一篇综述文章,详细介绍了在炎症性关节炎(包括类风湿关节炎、银屑病关节炎及强直性脊柱炎)中,肠道菌群如何通过调节药物的生物利用度、活性及毒性,以影响药物的改善效果,并讨论了如何将药物微生物组学应用于炎症性关节炎的精细医疗之中。①在多种疾病中,药物-菌群互作可影响患者对药物改善的应答;②肠道菌群及其代谢产物可调节炎症性关节炎改善药物的生物利用度、临床疗效及毒性;③例如,柳氮磺胺吡啶可被肠道菌群代谢为活性形式,而甲氨蝶呤可被肠道菌群代谢为非活性形式;④药物微生物组学研究用于炎症性关节炎精细医疗的潜在策略包括:肠道菌群作为预测改善应答的生物标志物、调控菌群以增加药物的生物利用度及疗效、抑制特定细菌酶活性以防止其将药物代谢为毒性产物。上海靠谱的肠道菌群检测公司?--就选上海沃本!江苏亚健康人群菌群检测风险预测
肠道菌群检测--解读人类“第二基因组”。上海神经类疾病菌群检测预测疾病
肠道菌群变化与系统性红斑狼疮(SLE)相关。来自北京协和医院的张烜团队及中科院微生物所的王军团队在Arthritis and Rheumatology上发表的一项队列研究结果,对比鉴定了未改善SLE患者的肠道菌群组成与功能变化,并发现在SLE患者中富集的部分菌种来自于口腔菌群,且来自这些SLE相关细菌的多肽可通过分子模拟触发自身免疫应答。该研究结果提示,调控肠道菌群或可作为改善SLE的潜在辅助疗法。对比117名未改善SLE患者、52名改善后SLE患者及115名对照的粪便菌群;②SLE患者的肠道菌群组成及功能与对照有明显差异,脆弱拟杆菌等特定菌种在SLE患者中富集,在接受改善后减少;③SLE患者肠道菌群中的LPS生物合成通路富集,支链氨基酸生物合成通路减少;④SLE小鼠的肠道菌群变化与SLE患者相似;⑤SLE患者中富集的菌种部分来自于口腔菌群,并与口腔炎症密切相关;⑥来自SLE患者中富集的菌种的多肽可通过分子模拟自身抗原以触发自身免疫应答。上海神经类疾病菌群检测预测疾病
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