病毒宏基因组测序:在运用宏基因组测序方法检测的样本量位居全球前列,样本总数居国内第二,其中脑脊液检测量位列全球前二强。除了传染病的应用场景之外,利用mNGS还可以对菌群进行菌株鉴定分型、耐药基因与毒力基因的检测,适用于抗传染院内传染管理的评估。在越来越多的证据表明微生物对人体免疫系统能够产生影响,以及微生物菌群会参与到神经退行性疾病、糖尿病等疾病的发生和发展当中,微生物疗法获得了越来越多的关注,而mNGS未来也可以为人们深入分析人体菌群微生态、研究微生物疗法提供一种可靠的技术手段。宏基因组测序对环境样本所有微生物基因组DNA进行提取和高通量测序,分析样本环境中微生物基因组信息。郑州宏病毒组测序分析诊断
病毒宏基因组测序的流程:在探普生物进行病毒宏基因组测序的流程非常简单,简而言之,客户只需要说清楚样品情况,准备样品即可,其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下:1)与销售人员沟通项目需求和样本情况;2)探普生物工作人员拟定项目合同,双方协商合同内容后签字盖章;3)按样本准备指南准备好样本,填写信息单后通知销售人员预订干冰,安排样本寄运输;4)客户支付项目启动款,探普生物启动项目实验和分析并提供测序报告;5)客户支付项目尾款,探普生物提交测序数据和分析结果;6)售后问题处理,项目结题。北京病毒多样性测序分析诊断宏基因组技术都是在细菌领域使用的。
宏基因组技术都是在细菌领域使用,病毒的样本收集困难、文库构建繁琐、数据库不完善,因此宏基因组技术未能获得普遍应用。生物进行病毒宏基因组测序,样品具备什么条件才可以获得比较质量的宏基因组分析效果?其他公司对用于测序的样本的要求较高。而在探普生物进行病毒宏基因组测序,基于探普的专有流程,样本要求非常低,不要求总量到达微克,探普有专门的收样标准和送样流程。为了保证后续数据的有效利用率,需要客户配合完成合格的取样步骤和样本前处理步骤。当然探普也提供适当的样本处理服务。核酸性质有RNA和DNA之分,核酸链还有单双链之分,而核酸本质不同和单双链的不同,进行同样的实验步骤其效率也不一样。
病毒相关知识:病毒是地球上数量多的生物实体,其中细菌病毒(即噬菌体)约有1031个类群,从海洋到陆地再到人体几乎都是它们的栖息地。研究者将病毒视为调节人类生态系统的重要成员,人体内主要包括真核病毒和噬菌体,包括双链DNA(double-strandedDNA,dsDNA),单链DNA(single-strandedDNA,ssDNA)和RNA病毒。随着对病毒研究的普遍开展,“病毒组”与“病毒组学”的概念也应运而生,这些术语分别涵盖了栖息在生态系统中的所有病毒及其基因组和对它们的研究(LefkowitzEJ,etal,2017)。根据病毒不同的特征进行分类,包括病毒的宿主范围;病毒的形态学;病毒的基因组大小;病毒的核酸组成成分以及病毒的致病性。虽然所有的性状在病毒分类学的确定中都很重要,但目前利用平均核苷酸同源性(ANI)和系统发育关系进行序列比较被视为定义和区分病毒群类的主要标准。对样本进行宏病毒组测序于临床,能辅助临床医生进行微生物侵染类疾病诊断并在一定程度提供用药指导。
在传统的诊断检测中对病原体的诊断检测是通过体外培养的方式进行,但是不同微生物的培养条件不一样;不同的微生物的培养技术要求也不一样;同时,体外培养受时间、空间和培养技术人员的限制。宏基因组分析技术是一种的病源体诊断检测技术,可以在不通过任何培养过程的条件下,通过基因序列的比对,发现和鉴别罕见病源体引起的疾病,从而针对性地使用药物,使病源微生物传染所形成的疾病的准确、高效。元基因组(宏基因组)学研究不要求对每个微生物进行分离、纯化和培养,而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过元基因组测序,能够揭示微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学的研究范围。病毒宏基因组也是旨在研究微生物群体中的物种分布规律和差异,通过大数据分析微生物群体的功能。郑州宏病毒组测序分析诊断
科学家通过对病毒进行全基因组测序,能了解病毒不同传播阶段的变异情况。郑州宏病毒组测序分析诊断
病毒宏基因组测序可直接对样本中的核酸进行高通量测序,鉴定样本中可能存在的病原菌,辅助临床决策。覆盖细菌、病毒、寄生虫、衣原体、立克次氏体、螺旋体等13396种微生物;同时进行耐药基因检测,涵盖266种耐药菌,2984种抗性基因。宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用:发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限,可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象,从而能够快速地鉴定出标本中存在的病毒,形成了一门研究特定环境中病毒群落的新兴学科:病毒宏基因组学(宏病毒组)。郑州宏病毒组测序分析诊断
上海探普生物科技有限公司是一家从事生物科技专业领域内技术开发、技术转让、技术咨询、技术服务,化工原料及产品(除危险化学品、监控化学品、烟花爆竹、易制毒化学品),实验室设备,计算机、软件及辅助设备,电子产品销售,计算机软件开发及维护,计算机信息系统集成服务等。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。上海探普生物作为从事生物科技专业领域内技术开发、技术转让、技术咨询、技术服务,化工原料及产品(除危险化学品、监控化学品、烟花爆竹、易制毒化学品),实验室设备,计算机、软件及辅助设备,电子产品销售,计算机软件开发及维护,计算机信息系统集成服务等。的企业之一,为客户提供良好的病毒测序,病毒全基因组测序,病毒宏基因组测序,未知病原鉴定。上海探普生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心,为用户带来良好体验。上海探普生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使上海探普生物在行业的从容而自信。