测序技术:在病毒的鉴定及诊断中,通过高通量测序技术和RT-PCR方法的联合使用,可以实现优势互补,提高阳性检出率。更为重要的是,利用高通量测序技术还可以对病毒序列进行组装,获得病毒全长基因组信息,为监测病毒变异、探究致病机理提供研究基础。本次报告将围绕高通量测序技术在检测中的方法和策略展开分享。高通量测序技术的飞速发展使其在病毒学研究领域得到了越来越普遍的应用。无论是突发病情的应急处理、新病毒的发现,还是较大规模的分子流行病调查,高通量测序技术都比一代测序技术有着巨大的优势。SFTS病毒(SFTSvirus,SFTSV)是2009年在中国新发现的一种布尼亚科白蛉病毒属的蜱传病毒,为新发传染病发热伴血小板减少综合征(Severefeverwiththrombocytopeniasyndrome,SFTS)致病病因,现在在中国至少20个省流行。病毒全基因组测序产品特点:样本的所有病原信息一网打尽。RNA病毒序列测序突变分析技术
病毒全基因组测序定:上海探普生物科技有限公司的对病毒的全基因组进行测序有什么优势?全国开设病毒相关测序的公司不超过5家,只有探普生物是专门为病毒研究者服务的,探普生物的研发团队和实验团队都来自全国各地病毒学、微生物学专业的高校,硕士及以上学历成员超过60%,团队具备普通测序实验和分析基础之外,同时具备病毒学及微生物学的学术背景,相当了解病毒相关样本情况、研究方向等。研究者在项目咨询的时候就可以明显感觉到探普生物的专业性,沟通顺畅,省时省力。RNA病毒序列测序突变分析技术对病毒全基因组进行测序,是利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因组序列。
对病毒进行全基因组测序:在探普生物长时间运行过程中,我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先,从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因,搭载一定频率的全基因组测序。这样的组合省时省力省经费,同时能达到研究目的。此外,有的单位需要对传染病的病原进行流行病学监测和研究,如疾控/疫控中心、医院的传染病科室以及一些高校和研究所的相应课题组,可能需要对病毒的全基因组进行测序以后,结合其他上下游的研究数据,达到研究或者监测疫病的目的。
病毒全基因组测序定中为了便于新发或罕见病毒性传染病的筛查检测,利用多重置换扩增技术,以负链RNA病毒—发热伴血小板减少综合征病毒和正链RNA病毒—登革病毒为模拟样本探索临床样本中RNA病毒基因组非特异性扩增方法。研究中通过梯度稀释的RNA病毒模拟样本中可能存在的不同丰度的病原体,样本核酸依次加工成单链cDNA,双链cDNA,T4DNA连接酶处理后的双链cDNA以及添加外源辅助RNA后合成并连接的双链cDNA形式,然后进行Phi29DNA聚合酶等温扩增,使用荧光定量PCR方法比较各种方法对RNA病毒核酸扩增的影响。病毒全基因组测序产品特点:结果稳定可靠。
二代测序可以用于对病毒的全基因组进行测序有哪些挑战?二代测序相较sanger测序,差异主要就是单次运行可以获得海量的数据量,因此也称为高通量测序。想要通过高通量测序获得病毒全序列,需要经历:核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这三大基本流程。而高通量测序技术本身并不是以病毒为目标开发的,因此每个环节都是挑战。核酸纯化步骤决定了Input核酸的起始浓度和总量,从而决定了文库构建的成败、质量和产量;文库的好坏决定了数据的质量和产出;而数据的质量产出直接影响分析结果。样品一般核酸浓度很低,且带有大量宿主污染,因此实验部分和分析部分都比较困难。探普生物基于这些困难点,进行了大量有针对性的研发和测试,开发了全套的实验和分析流程用于对病毒的全基因组进行测序,该流程自运行以来广受研究者们好评。病毒全基因组测序具有的特点:专业化服务。长沙全基因组测序公司
病毒全基因组测序产品特点:基于PCR技术和抗原抗体技术的售后验证平台。RNA病毒序列测序突变分析技术
第二代测序技术的应用:第二代测序技术(NGS)因其快速和灵敏的检测特点已成为植物病毒学研究的强有力工具,这一技术具有非序列依赖性的优势,能同时检测植物样品中可培养和不可培养的、含量高及含量低的所有的DNA病毒、RNA病毒以及类病毒,它的出现极大地变革和推进了病毒的发现历程,近期来自浙江大学生物技术研究所等处的研究人员围绕NGS及其在植物病毒发掘中的应用研究和前景进行概述和展望。对分离培养和临床标本的病毒核酸的测序实验及分析流程。基于无差别的样本处理方式和独特的生物信息学分析流程,除了对于被宿主核酸污染的病原微生物/病毒核酸样本进行全基因组和宏基因组测序之外,未知病原也在探普特有的流程下可以得以鉴别。RNA病毒序列测序突变分析技术
上海探普生物科技有限公司致力于医药健康,是一家服务型公司。公司业务涵盖病毒测序,病毒全基因组测序,病毒宏基因组测序,未知病原鉴定等,价格合理,品质有保证。公司从事医药健康多年,有着创新的设计、强大的技术,还有一批**的专业化的队伍,确保为客户提供良好的产品及服务。在社会各界的鼎力支持下,持续创新,不断铸造***服务体验,为客户成功提供坚实有力的支持。