CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:
互作蛋白筛选和验证:数据分析以非标定量信号强度(LFQintensity和FC>10)作为强阳筛选,以文献查阅,功能匹配,批量CoIP-WB验证,提高验证成功率。理想CoIP-MS结果的蛋白定量都到超过1000种蛋白。其中绝大部分蛋白为非特异结合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信号强度和差异倍数作为参考(相对强信号和差异),分析实验组中明显定量较高且差异较大的蛋白,作为重要候选蛋白。同时对重要候选蛋白进行STRING互作分析,文献分析,目的蛋白功能匹配分析,选择Top的4-5个蛋白进行CoIP-WB验证,提高CoIP-WB成功率。 Co-IP技术强大有效,探索蛋白质互作奥秘,助力疾病药物研发,前景广阔!新疆互作机制CoIP-mass spectrometry
Co-IP(免疫共沉淀)和ChIP(染色质免疫沉淀)研究对象和应用方面的区别。研究对象:Co-IP主要研究的是蛋白质与蛋白质之间的相互作用,而ChIP则主要用于研究DNA(启动子)与蛋白质(如转录因子等)之间的相互作用。应用方面:Co-IP常用于验证两种蛋白质是否在体内存在相互作用,是确定蛋白质复合物组成的有效手段。而ChIP则更常用于研究转录因子与DNA的结合情况,揭示转录调控的机制,也是确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的一种很好的方法。总的来说,Co-IP和ChIP各有其独特的优点和应用价值,选择哪种方法取决于研究的具体问题和目标。新疆互作机制CoIP-mass spectrometryCo-IP技术直接、特异、灵敏,适用性广,兼容性强,是研究蛋白互作的利器!
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点:
抗体关键质控:抗体特异性和亲和效价要求高,尽量采用标签抗体或经过CoIP效果验证的抗体。抗体质量参差不齐(WB能检测到预期条带不到1/2,能检测到良好结果的不到1/4)和存在非特异性结合(几乎所有的抗体都存在非特异结合,部分非特异结合条带远大于目的条带),CoIP-MS需做WB和CoIP-WB质控。初次和检测CoIP都需要做WB质控。正式CoIP可同时增加考染/银染质控。抗体可参考数据库(ValidatedAntibodyDB,)。
对于新手来说,入门Co-IP技术需要掌握其基本原理,熟悉实验步骤,并注重操作细节。首先,要理解Co-IP技术是如何利用抗原与抗体的特异性结合来捕获和纯化蛋白质复合物的。其次,通过查阅相关文献和教程,学习实验的详细步骤,包括细胞处理、抗体选择、免疫沉淀和Western Blot检测等。在实践操作中,新手要注意实验条件的控制,如温度、pH值和离子强度等,以确保实验结果的准确性。此外,选择合适的抗体和洗涤缓冲液也是实验成功的关键。同时,耐心和细心也是必不可少的,因为Co-IP实验需要多次洗涤和分离步骤,任何一个环节的疏忽都可能导致实验失败。另外,新手可以参加相关的培训课程或研讨会,与同行交流学习,不断提升自己的实验技能和理论知识。通过不断学习和实践,相信新手可以逐渐掌握Co-IP技术,为后续的蛋白质相互作用研究打下坚实基础。免疫共沉淀是研究蛋白质相互作用的方法,可用于确定候选或未知蛋白的相互作用,并可通过WB或质谱检测。
Co-IP实验的外源检测与内源检测各有其优缺点。外源检测的优点在于其可控性高,能精确地表达目标蛋白及其标签,且背景清晰,易于检测。此外,外源检测系统通常更为敏感,能够检测到较弱的相互作用。然而,其缺点也显而易见,即不能完全模拟体内的真实环境,可能导致某些体内特有的相互作用无法被检测到。内源检测则能更真实地反映生物体内的蛋白质相互作用情况,因为它直接利用细胞内的天然蛋白。然而,这种方法的挑战在于细胞内蛋白表达的复杂性和多样性,可能导致背景噪声高,难以准确检测目标蛋白。此外,内源检测的灵敏度通常较外源检测低。综上所述,选择外源检测还是内源检测,需根据实验目的和具体情况来权衡。如需高灵敏度和可控性,可选择外源检测;如需更真实地模拟体内环境,内源检测可能更为合适。Co-IP技术揭示蛋白互作,助力药物研发与疾病机制探索!广东免疫沉淀CoIP Western Blot检测
Co-IP实验要点:样品新鲜、抗体特异、偶联充分、洗涤彻底,确保结果准确可靠!新疆互作机制CoIP-mass spectrometry
免疫共沉淀实验步骤主要包括以下五个部分:样品处理:将细胞或组织样品进行裂解,得到待检测的蛋白质混合物,并加入蛋白酶抑制剂以避免目标蛋白被降解。抗体处理:将专一的抗体连接到亲和树脂上,如蛋白A的亲和树脂或蛋白G的亲和树脂,或将蛋白与其特异性抗体结合,新形成的复合物与封闭剂缓慢摇摆在二氧化硅珠上,使碘酸钙交联后节制反应。免疫共沉淀:将有抗体树脂的样品与吸附抗体树脂形成免疫复合物。洗涤:采用洗涤缓冲液对样品进行洗涤,以去除非特异性的蛋白质和杂质,同时尽量避免对复合物的影响。洗涤缓冲液选择对样品不会引起较大影响的缓冲液和洗涤剂。蛋白鉴定:将沉淀的复合物通过SDS-PAGE分离出来,并进行Western blotting检测目标蛋白及其配偶蛋白。另一方面,也可以直接使用质谱分析检测。新疆互作机制CoIP-mass spectrometry