qPCR法,即定量聚合酶链式反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction)法,是一种高度灵敏和特异的分子生物学技术,用于检测和定量DNA序列。在支原体检测中,qPCR法的原理主要包括以下几个步骤:
1. DNA提取:首先从待测样本中提取DNA,这可能包括细胞培养上清液或组织样本中的支原体DNA。
2. 设计特异性引物:针对支原体的保守DNA序列,如16S rRNA基因,设计特异性的DNA引物。
3. 荧光标记探针:使用荧光标记的探针,该探针与目标DNA序列互补,能够在PCR扩增过程中与扩增的DNA结合。
4. Ct值确定:Ct值(阈值循环数)是指在PCR反应中,荧光信号强度超过预定阈值的循环次数。Ct值越低,表示样本中支原体DNA的量越多。
5. 定量分析:通过标准曲线法或相对定量法,将Ct值转换为支原体DNA的定量结果。
qPCR法的优势在于其高灵敏度和特异性,能够检测到非常低水平的支原体污染,并且可以在短时间内提供结果,这对于需要快速检测的生物制品生产和细胞培养质量控制非常重要
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支原体污染后的细胞是否应该直接丢弃还是尝试重新培养,这取决于多种因素,包括细胞的重要性、污染的程度、以及是否有有效的方法来清*支原体。以下是一些处理支原体污染的常见方法:
1. 直接丢弃:对于非重要的细胞,如果培养中的细胞、WCB的细胞等,可以采取直接将培养物与用过的培养基灭活后丢弃的方式。
2. 使用支原体清除剂:支原体清除剂处理细胞,作用浓度为25μg/ml,两周可以清*支原体。
3. 使用支原体清*培养基:每2~3天更换一次新鲜培养液,并用无菌的PBS洗涤细胞,处理15天后进行支原体检测,以确定支原体是否被完全去除。
4. 支原体去除试剂:这是一种混合制剂,可以通过抑制DNA和支原体生长所必须的相关蛋白合成来取得良好的支原体清*效果,且对细胞无伤害
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细胞培养中,需要去除支原体的污染:支原体污染是细胞培养中 普遍的问题之一,细胞库中或正在使用的细胞中,支原体的污染率约为15%-35%。并对培养细胞的生理和代谢造成诸多影响:
01/ 争夺营养 – 阻碍细胞生长和增殖
02/ 改变蛋白质、RNA 或 DNA 合成的水平
03/ 改变基因表达、细胞信号传导和形态
04/ 损害膜和细胞器
05/ 导致突变和染色体变化
06/ 时间、金钱和有价值的细胞丢失,耽误研究时间
07/ 实验结果的不可靠性,实验结果的重复性 降低
08/ 生物安全问题
细胞培养中支原体污染的检测方法有多种,以下是一些常用的检测手段:
1. 显微镜检测:通过相差显微镜观察细胞,支原体在细胞表面和细胞之间会呈现为暗色微小颗粒。
2. 荧光染色法:使用荧光染料Hoechst 33258与DNA特异性结合,使支原体的DNA着色,然后在荧光显微镜下观察。染色后的支原体会在细胞周围或附于细胞膜表面显示为亮绿色小点。
3. 电镜检查:使用扫描电镜或透射电镜观察,这是一种简便快速的方法。
4. 聚合酶链反应(PCR):使用特定的引物对支原体DNA进行扩增,是一种高灵敏度的检测方法。
5. 等温扩增法:基于LAMP技术,室温反应后观察颜色变化确认是否有支原体污染。
支原体检测PCR法和LAMP方法的优劣势比较。
支原体检测中的PCR法和LAMP方法各有其优势和劣势,以下是两种方法的比较:
PCR法
优势:
1.高灵敏度:PCR法可以扩增支原体DNA,具有很高的灵敏度。
2.操作简便:PCR操作相对简单,结果准确,速度快,通常3个小时左右即可得到结果。
3.可靠性:PCR法已成为日常细胞培养维护的可靠方法,是细胞样本库保护细胞的方法。
劣势:
1. 样品量需求:相对于某些快速检测方法,PCR可能需要较多的样品量。
2. 检测周期:尽管PCR法相对快速,但在某些情况下,检测周期可能较长。
LAMP法
优势:
1. 设备简单:只需要一个稳定的恒温环境,如恒温水浴或热拟温器,不需要复杂的温度控制设备。
2. 高特异性:LAMP技术采用多个特异性引物,提供了较高的特异性。
3. 结果可视化:LAMP扩增产物可形成肉眼观察的颜色产物,有助于直接观察扩增结果。
劣势:
1. 引物设计复杂:需要设计多个引物,包括外部引物、内部引物和环引物,引物设计较为复杂。
2. 避免污染:由于没有封闭系统,避免污染造成的假阳性是一个问题。
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LAMP法,即环介导等温扩增法(Loop-mediated isothermal amplification),在支原体检测中的应用具有以下特点和应用场景:
1. 日常监测:由于LAMP法的快速和简便性,它适用于生物实验室的日常监测,可以及时检测出支原体的存在,确保实验结果的准确性和可靠性。
2. 疾病诊断:LAMP法已被成功应用于SARS、禽流感、HIV等疾病的检测中,并在2009年甲型H1N1流感事件中发挥了重要作用。
3. 临床应用:LAMP法在临床样本的检测中显示出了快速、高灵敏度和稳定性,可以用于检测实验室样本及临床样本中的支原体。
4. 多病原体检测:LAMP法可以同时检测多种病原体,包括肺炎支原体在内的多种下呼吸道感*的病原体,为临床诊疗提供询证依据。
5. 与其他技术结合:LAMP法可以与CRISPR-Cas12a等其他技术结合,建立新的检测方法,提高检测的效率和准确性。
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