16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列,16srRNA是由16srDNA转录来的,一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。通过观察和计数粪便样本中的细菌,可以了解人体肠道内的微生态环境。广东自闭症患者菌群检测临床应用
2007年底,美国国立卫生研究院(NIH)宣布将投入1.15亿美元正式启动酝酿了两年之久的“人类微生物组计划”。由美国主导的,多个欧盟国家及日本和中国等十几个国家参加的人类微生物组计划将使用新一代DNA测序仪进行人类微生物组DNA的测序工作,是人类基因组计划完成之后的一项规模更大的DNA测序计划,目标是通过绘制人体不同organ中微生物宏基因组图谱,解析微生物菌群结构变化对人类健康的影响。2008年4月11日,欧盟宣布启动人类宏基因组第七框架项目,我国的生物公司也参加到肠道宏基因组欧盟第七框架项目中,承担重要的测序任务。2009年,英、美、法、中等国科学家在德国海德堡成立国际人类微生物组研究联盟(IHMC),旨在对国际人类微生物组研究进行相关的协调。2016年5月13日,美国启动“国家微生物组计划”,启动资金超过5亿美元。广东自闭症患者菌群检测临床应用通过菌群检测,我们可以提早发现可能导致疾病的微生物变化。
肠道菌群变化与系统性红斑狼疮(SLE)相关。来自北京协和医院的张烜团队及中科院微生物所的王军团队在Arthritis and Rheumatology上发表的一项队列研究结果,对比鉴定了未改善SLE患者的肠道菌群组成与功能变化,并发现在SLE患者中富集的部分菌种来自于口腔菌群,且来自这些SLE相关细菌的多肽可通过分子模拟触发自身免疫应答。该研究结果提示,调控肠道菌群或可作为改善SLE的潜在辅助疗法。对比117名未改善SLE患者、52名改善后SLE患者及115名对照的粪便菌群;②SLE患者的肠道菌群组成及功能与对照有明显差异,脆弱拟杆菌等特定菌种在SLE患者中富集,在接受改善后减少;③SLE患者肠道菌群中的LPS生物合成通路富集,支链氨基酸生物合成通路减少;④SLE小鼠的肠道菌群变化与SLE患者相似;⑤SLE患者中富集的菌种部分来自于口腔菌群,并与口腔炎症密切相关;⑥来自SLE患者中富集的菌种的多肽可通过分子模拟自身抗原以触发自身免疫应答。
肠道菌群与饮食的关系饮食结构与肠道菌群息息相关,饮食结构的改变同时会引起肠道菌群的组成变化和功能改变。高纤维饮食及补充短链脂肪酸、益生菌、益生元有助于改善肠道菌群的组成和功能;反之,高脂及高糖饮食起到相反的作用。一些研究表明,长期应用乳酸菌等,具有降压效应。进一步分析显示,乳酸菌可改善内皮功能和氧化应激,从而发挥降压作用。Circulation12年随访研究称,多吃红肉和加工肉,缺血性心脏病发生风险明显增加。而之前有研究表明,吃红肉越多,人体内TMAO的含量也就越多。肠道菌群--守护您的健康。
肠道菌群可以促进代谢。肠道菌群尤其是共生菌能够竞争营养供给,与宿主共同消耗营养来源,防止不需要的营养物质过度产生;四、维持平衡肠道菌群。还可以产生抑菌物质来减少有害菌的生长,维持菌群健康平衡。同时,肠道微生物不断刺激胃肠粘膜分泌粘液素,以保持肠道的润滑。在我们身边隐藏着各种破坏肠道菌群的因素,比如滥用药物,饮食不规律,年龄的增长以及其他环境因素等等。即便没有外界因素的干预,肠道菌群结构也是不断的向坏的方向发展。所以,通过各种方式改善肠道菌群,都应该是每个人必须要关注的事情。肠道菌群检测--高通量测序平台的应用。浙江肿瘤术后菌群检测常用方法
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(1)构建不同慢病和肠道菌群之间的关联数据库,促进慢病与菌群相关性、甚至因果性证据的进一步积累,促进人们对慢病发生、发展的深刻理解;(2)研究针对肠道菌群进行调控的新技术、新方法、新产品,提高慢病防控效率;(3)结合肠道菌群微生态,深入开展中医药研究,促进中医生命科学和中西医结合的研究与发展;(4)发展肠道菌群微生态的解析技术,不仅在微生物基因组DNA序列组装等方面取得进步,而且还需要从微生态这一群体水平开展从结构到功能的深入研究;(5)发展肠道菌群的检测技术即针对肠道菌群的健康体检技术,建立起可用于评价肠道菌群是否处于健康状态、亚健康状态、失调紊乱状态甚至致病状态的理论、方法和技术;广东自闭症患者菌群检测临床应用