微生物鉴定的传统的鉴定方法虽然仍被普遍使用，但存在两大缺点。它们只适用于可以体外培养的生物体，而且一些菌株表现出不符合已知种属模式的独特的生化特性。许多现代方法并不依赖于活的培养物，它们常常能揭示通过传统方法检测不到的有机体之间的细微差别。PCR，包括实时荧光定量PCR，可能是普遍应用于微生物鉴定的分子技术。利用PCR技术，可以快速检测和鉴定临床标本的微生物种类，从而加快诊断程序。大多数基于PCR的方法涉及一组通用的PCR引物，通过测序PCR扩增的序列来鉴定细菌/样品。16SrRNA基因是PCR细菌鉴定的金标准序列，而内部转录间隔区(ITS)区域是种类的主要条码标记。
病毒的结构简单,只含一种核酸,必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的生物。江苏病毒检测技术
病毒研究的发展：病毒研究的发展常常与病毒培养和检测方法的进步有密切的关系，特别在脊椎动物病毒方面，小鼠和鸡胚接种、组织培养、超速离心、凝胶电泳、电子显微镜和免疫测定等技术，对病毒学的发展具有深刻的影响。噬菌体的培养和检测方法简单。将噬菌体接种到易感细菌的肉汤培养物中，经18～24小时后，混浊的培养物重新透明，此时细菌被裂解，大量噬菌体被释放到肉汤中，再经除菌过滤，即为粗制噬菌体。为了测定其中噬菌体的数量，将粗制噬菌体稀释到每一接种量含100个左右，与过量的细菌混合，然后铺种于琼脂平皿上，在温箱中培养过夜医学教育|网搜集整理，细菌繁殖成乳白色衬底，被噬菌体裂解的区域则在此衬底上表现为圆形的透明斑，称为噬斑。江苏病毒检测技术室内舒适的温度，湿度等环境条件，为各种有害微生物滋生创造了条件.
微生物检测方法中比浊法是根据菌悬液的透光量间接地测定细菌的数量。细菌悬浮液的浓度在一定范围内与透光度成反比，与光密度成正比，所以，可用光电比色计测定菌液，用光密度(OD值)表示样品菌液浓度。此法简便快捷，但只能检测含有大量细菌的悬浮液，得出相对的细菌数目，对颜色太深的样品，不能用此法测定。测定细胞重量法此法分为湿重法和干重法。湿重法系单位体积培养物经离心后将湿菌体进行称重;干重法系单位体积培养物经离心后，以清水洗净放人干燥器加热烘干，使之失去水分然后称重。此法适于菌体浓度较高的样品，是微生物检测的一种常用方法。
未知病原微生物鉴定：除了利用病毒的致病性定量检测病毒外，还可应用物理方法，如在电子显微镜下计数病毒颗粒，或用紫外分光光度计测定提纯病毒的蛋白和核酸量，这些方法所测得的数据包括了的病毒粒。植物病毒的培养和检测大都是在整株植物上进行的医学教育|网搜集整理。从捣碎的病叶汁中制备病毒，常用枯斑法检测。用手指蘸上混有金刚砂的稀释病毒在植物叶片上轩轻摩擦，经一定时间后出现单个分开的圆形坏死或退绿斑点，称为枯斑。病原微生物检测方法-高通量测序技术。一般来说，在一定的培养条件下,同种微生物表现出稳定的菌落特征.
微生物鉴定系统：微生物鉴定系统的工作原理因不同的仪器和系统而异。不同的细菌对底物的反应不同是生化反应鉴定细菌的基础，而试验结果的准确度取决于鉴定系统配套培养基的制备方法、培养物浓度、孵育条件和结果判定等。大多微生物鉴定系统采用细菌分解底物后反应液中pH的变化，色原性或荧光原性底物的酶解，测定挥发或不挥发酸，或识别是否生长等方法来分析鉴定细菌。药敏试验分析系统的基本原理是将微量稀释在条孔或条板中，加入菌悬液孵育后放入仪器或在仪器中直接孵育，通过测定细菌生长的浊度，或测定培养基中荧光指示剂的强度或荧光原性物质的水解，观察细菌的生长情况。在含有培养基中，浊度的增加。室内舒适的温度，湿度等环境条件,为各种有害微生物滋生创造了条件。江苏病毒检测技术
病毒的结构简单、寄生性严格,以复制进行繁殖的一类非细胞型微生物。江苏病毒检测技术
病原微生物检测方法中的多种PCR结合使用，基因芯片技术与多重PCR结合可以通过PCR对目的基因进行放大，通过基因芯片的荧光探针增加检测的灵敏性和特异性，使得两种检测技术的优势互补，已应用于病原微生物的检测。将病原体特异性基因作为靶基因设计出引物与探针，进行多重PCR扩增，制备出寡核苷酸芯片，再对待测样本靶基因进行多重PCR扩增，将扩增产物与病原菌多重PCR基因芯片检测体系杂交，可根据杂交信号直观地判读样品中所含病原体的种类、型别、毒力、侵袭力，从而对病原体进行检测和鉴定。江苏病毒检测技术
