整合位点方法

遗传物质整合到宿主基因组中、患者长期处于免疫抑制状态诱发（恶性）形成；建议研究病毒整合至目标细胞的典型特征，包括优势插入位点、插入拷贝数、优势克隆异常生长等。关注基因附近是否存在优先整合情况及潜在的致风险。致瘤性的风险：考虑产品特征，所使用整合性载体（如逆转录病毒或转座子等）将外源基因插入到基因组中可能会插入到原基因附近jihuo该基因导致患者风险增加。基因zhiliao产品可能会采用修饰宿主基因组的技术，并有可能在宿主细胞或组织中持续存在。很多基因zhiliao载体的基因整合不会指向基因组的特定位点，可能在整合位点处产生插入突变、或jihuo整合位点附近的原基因等，进而破坏重要基因功能或增加恶性的风险。插入位点整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。整合位点方法

插入突变风险评估一些整合性载体（如逆转录病毒、慢病毒、转座子）可将外源基因插入整合到细胞基因组中，这可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。影响插入突变的关键风险因素包括：（1）载体的整合特征，如插入位点的偏好性；（2）载体的设计，如增强子、启动子等构建元件的活性，影响邻近基因的潜力；产生剪接突变体的潜在剪接位点或多聚腺苷酸信号等；（3）细胞载体拷贝数；4）转基因表达产物的功能活性（如与细胞生长调控相关）和表达水平；5）靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。深圳CAR-T整合位点报告迎细胞基因浪潮,整合位点分析方法来助力。

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。

通常不需要进行标准的遗传毒性组合试验，但应根据基因zhiliao产品的特点、产品的具体适应症、载体的已有信息、导入基因序列结构等，评估基因zhiliao产品整合进基因组的可能性，判断是否需要开展另外的遗传毒性研究，如研究基因组修饰的发生情况，并检测随后可能发生的异常细胞行为；评估插入突变（插入位点、插入拷贝数等）引起的遗传毒性风险。当基因zhiliao产品采用基因编辑或转座子技术时，需要关注脱靶编辑、转座子转座印迹引起的遗传毒性问题；鉴定/表征基因组整合位点。含有完整的外源DNA全部整合结构、插入位点旁侧序列和受体基因组在整合位点附近重排结构的CCS reads。

相较于LM-PCR方法，重组细胞全基因组重测序需要较大数据量，比较适合用于经过表型筛选的单克隆细胞的测序，比如用于抗体药物生产重组CHO细胞的位点检测，但全基因组测序可对宿主基因组自身的变异进行检测。应用场景：CAR-T细胞安全性检测（药物申报）；基因zhiliao研究中使用的病毒性载体的安全性检测等；1.LM-PCR不适合评估每个整合位点插入序列发生的变异，不适用于插入序列的拷贝数检测，拷贝数检测可以采用qPCR方法进行。2.INZR-WGS（WGS法）整合位点技术，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。北京整合位点安全性评价

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细胞和基因疗法可进一步分为体内zhiliao和体外zhiliao，体外zhiliao是将患者的体细胞从体内分离，在体外进行培养并使用携带有正常基因片段的载体修复突变基因，通过注射的方法将改良后的细胞回输入患者体内以进行疾病的zhiliao。体内zhiliao是利用较为直接的方法对局部或全身注射含有修复基因片段的病毒或非病毒载体，常用AAV等非整合型载体。利用慢病毒载体导入外源序列时其插入位置具有随机性，可能会引起正常基因失活，如果插入某些控制细胞分裂的基因中会导致变。所以检测重组细胞的整合位点来评价细胞的安全性就显得尤为重要。整合位点方法

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