除了获得载体的滴度及产量，生产慢病毒更关心的指标主要是各种污染物的去除。总DNA污染的去除百分比在99.1-99.84%，总蛋白污染物的去除百分比在99.85-99.9%。针对宿主细胞的DNA（HCD）及蛋白（HCP），有报道其去除百分比分别为99.8%和99.4%。因为不仅残存的DNA可能是个问题，而且DNA的大小以及由此引起的可能转移整个有功能的开放阅读框也是问题，因此监管机构对残存DNA污染的分子量上限的要求越来越高。例如，FDA的指南‘生产用于传染病适应症的病毒疫苗的细胞基质和其他生物材料的特性和鉴定’中说明，残留的细胞宿主的DNA片段不能超过一个功能基因的长度，估计在200bp左右。宿主细胞DNA主要以染色质形态存在，其中组蛋白通过离子作用及疏水作用与DNA紧密结合；山东M-SAN HQ中盐核酸酶70950
M-SAN HQ中盐核酸酶在生理盐条件下的优势，让其成为生物生产工艺中去除核酸污染的更好选择。经过多年的市场宣传，M-SAN HQ中盐核酸酶品质已得到多个全球TOP CDMOs认可，纳入其工艺开发筛选平台。此外，目前全球有10+临床项目涉及的病毒载体生产用到M-SAN HQ中盐核酸酶。对于同一个项目，用M-SAN HQ替代Benzonase全能核酸酶，酶量减少、HCD去除效果更优、病毒载体产量也有一定程度的提高，酶相关成本降为原有的1/5以内，极大降低了病毒载体生产成本。湖南等渗条件中盐核酸酶70950-202M-SAN HQ中盐核酸酶不需调整培养基任何组分，使用简单方便；
慢病毒大规模纯化的捕获步骤包括：膜过滤澄清，随后切向流过滤/超滤或者体积排阻色谱浓缩。此外，需用核酸酶（benzonase或M-SAN HQ中盐核酸酶）来去除细胞残留的、质粒来源的DNA污染。这两个步骤顺序可以调整，依据项目工艺而定。两种工艺路线各有优缺点：先用核酸酶消化的优点是可去除大的DNA片段，且后续步骤可以去除残留核酸酶；但所用的核酸酶的量也非常大。与此相反，将核酸酶步骤后置的优点是大幅降低核酸酶的量(成本降低)；但后面的步骤必须有将核酸酶去除的能力。此外，后期用核酸酶的缺点是核酸污染可能会结合慢病毒颗粒形成沉淀，进而导致慢病毒在纯化中流失，从而影响得率。
宿主细胞DNA（HCD）残留以染色质形式存在，其中有带负电荷的DNA、带正电荷及疏水区段的组蛋白，就像胶带一样能够吸附很多物质，包括各种杂蛋白、色谱填料、目的病毒颗粒。非特异吸附杂蛋白，会影响蛋白杂质（如HCP）等的去除；吸附到色谱填料上，会降低色谱分离纯化效率；吸附到目的病毒颗粒时，会影响目的产物的稳定性，从而降低目的产物的得率。因此，从生产工艺层面来讲，一定要去除HCD，从而能够简化工艺、提高目的产物的产量。M-SAN HQ中盐核酸酶不含动物源成份，无蛋白酶活性；
一般来说，生物生产工艺用的核酸酶以BenzonaseTM（BenzonaseTM是Merck的注册商标）为主，能高效降解任何形式（双链、单链、线状、环状）的DNA和RNA。该酶来自于大自然界普遍存在的S.Marcescen，通过E.coli发酵生产得到。该酶的适宜反应条件是低盐浓度范围（<100mM盐浓度），且酶活随着盐浓度上升而下降，在300mM盐浓度时酶活几乎丧失。对于细胞基因药物常用的两种病毒载体LV和AAV，LV由于含有脂包膜结构一般都在生理盐条件下存在，而AAV在高盐条件下不易团聚、更稳定。而在生理盐浓度及更高浓度条件下，Benzonase活性受到抑制。M-SAN HQ中盐核酸酶的检测标准，都符合USP-EP要求。陕西ArcticZymes中盐核酸酶
琼脂糖胶结果显示，M-SAN HQ中盐核酸酶能将HCD消化成小于8nt的片段。山东M-SAN HQ中盐核酸酶70950
基因药物常用的AAV载体有三种生产方法，分别是三质粒瞬转体系、杆状病毒表达载体体系和包装细胞体系。其中，20多年前开发的三质粒瞬转表达技术仍然占据腺相关病毒AAV生产的主流地位，其三质粒分别是Helper质粒（含E2a/b、E4和VARNA基因）、目标基因表达质粒及辅助质粒（含Cap和Rep基因）。虽然AAV病毒载体的血清型不同，但AAV的生产流程基本一致，主要有质粒共转宿主细胞HEK293、293细胞生产病毒颗粒、从细胞培养上清或/及细胞裂解液中收获病毒载体、纯化/制剂/无菌过滤/灌装等流程。山东M-SAN HQ中盐核酸酶70950
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