凡是以有机物质(含有碳元素的化合物) 作为肥料的均称为有机肥料。通常来说，有机肥就是动植物死亡的残体和动物排泄的粪便。有机肥分为商品有机肥和农家肥。农家肥包括土肥、厩肥、圈肥、沤肥、堆肥、绿肥、人尿粪等。有机肥里面不仅含有丰富的有机质和有机酸，比如腐植酸、氨基酸、黄腐酸，而且还含有各种大、中、微量元素，虽然含量低，但比较***。一般来说，氮长叶、磷长花、钾长果；硅保根、钙保果、镁保叶、硫保味；铁防黄叶、铜防落叶、钼防花叶、锌防小叶、硼防卷叶。经此过程的堆肥可以达到三个目的，一是无害化；二是腐殖质化；三是大量微生物代谢产物。福建有机肥厂
有机肥料中的腐殖质含有脂、蜡和树脂，由于在具有较高肥力的土壤成土过程中，这些物质能浸润土壤团块，使其具有疏水性，减弱土壤浸湿过程和毛管水的移动速度，使土壤水分的蒸发量减少和土壤持水能力增强，因而改善了土壤水分状况。
研究腐殖质亲水性和疏水性的结果表明，它们是由胡敏酸分子边缘上侧链决定的，当胡敏酸分子的聚合度较小时，其侧链基团的量露程度较大，它们之间存在着反比关系，腐殖质物质与水分子的关系，在一定程度上决定着有机物质的水分性质。
团粒结构与土壤有机质含量和施用的有机肥料数量有关，水稳性团粒结构能保证土壤表层的疏松性，利于土壤透水。这种结构的特点是团聚体疏松，非毛管孔隙度大，因而能减低土壤中水分毛管运动的高度和速度，减少土壤表面水分蒸发。团粒性结构较好的土壤颗粒结构半径较其差的土壤颗粒结构半径为大，而毛管水上升运动速度与结构单位的半径成反比。
上海有机肥产品有机肥料才是生产绿色食品的主要肥源。
根据不同质地土壤中有机肥料养分释放转化性能和土壤保肥性能不同，应采用不同的施肥方案。沙土土壤肥力较低，有机质和各种养分的含量均较低，土壤保肥保水能力差，养分易流失。但沙土有良好的通透性能，有机质分解快，养分供应快。沙土应增施有机肥料，提髙土壤有机质含量，改善土壤的理化性状，增强保肥、保水性能。但对于养分含量髙的质量有机肥料，一次使用量不能太多，使用过量也容易烧苗，转化的***养分也容易流失，养分含量高的质量有机肥料可分底肥和追肥多次使用。也可深施大量堆腐秸秆和养分含量低、养分释放慢的粗杂有机肥料。
黏土保肥、保水性能好、养分不易流失。但土壤供肥慢，土壤紧实，通透性差，有机成分在土壤中分解慢。黏土地施用的有机肥料必须充分腐熟；黏土养分供应慢，有机肥料应可早施，可接近作物根部。旱地土壤水分供应不足，阻碍养分在土壤溶液中向根表面迁移，影响作物对养分的吸收利用。应大量增施有机肥料，增加土壤团粒结构，改善土壤的通透性，增强土壤蓄水、保水能力。
矿物源有机肥的原料的前体是动植物残体千百年矿化而成风化煤、褐煤，在改良土壤团粒结构、提高矿质营养元素利用率方面效用更佳。
生物质有机肥的原料以畜禽粪便及秸秆腐熟为主，富含氨基酸、核酸、多肽、蛋白酶等活性成分，对树体的调理效用更明显。
因此，土壤退化重的果园用矿物源有机肥更好，土壤情况良好的单施生物质有机肥就行。
有机肥施用量允许变化幅度较大，一般不会危害作物生长。
有机肥含有大量的有机质，具有明显的改土培肥的作用。有机肥含有多种养分，肥效持久，肥料中没有任何化学合成物质，长期施用可以改善农产品品质。
有机肥经过充分腐熟处理，施用后可提高作物的抗旱、抗病、抗虫能力，减少农药的使用量。有机肥料中含有大量的有益微生物，可以促进土壤中的生物转化过程，有利于土壤肥力的不断提高。有机肥合理施用
有机肥一般作基肥施用，也可作追肥。作基肥时先撒施，然后结合翻地深施均匀。
还有就是壅根，蔬菜种植中将腐熟的有机肥壅在作物根部，可以起到促根壮秧的效果。
有机肥在蔬菜种植中另一种施用方式是条施，即作物生长期作追肥，在作物行矩中间开一道沟，条施有机肥。同时顺沟灌水，然后土壤填沟。条施有机肥作追肥对作物生长期营养输送有特别好的效果。
有机肥还可使土壤变得疏松，改善作物根系的生态环境。天津有机肥
有些菜农对有机肥的认识不足，认为没有化肥见效快，另外有机肥要配合使用化肥还嫌麻烦。福建有机肥厂
有机肥腐解后，为土壤微生物活动提供能量和养料，促进微生物活动，加速有机质分解，产生的活性物质等能促进作物的生长和提高农产品的品质，不仅吃瓜瓜甜，吃麦麦香，更重要的是通过微生物分解出的有机酸能够活化土壤中被固定的矿物质元素得以充分的吸收和利用。真正的有机肥不得溶化，也不能溶化，因为有机肥里面含有大量的纤维素和木质素不能被水溶解，它必须是通过土壤中的微生物菌来进行分解，转换为氨基酸和碳水化合物才能够被果树根系吸收，这是一个缓慢而持久的过程。
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