微生物菌剂是指目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂（如草炭、蛭石），吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、预防土传病害、维持根际微生物区系平衡和降解0害物质等作用。
农用微生物菌剂恰当使用可以提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。
按剂型可分为：液体、粉剂、颗粒型；
按内含的微生物种类或功能特性可分为：根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。
按照复合方式分为：微生物菌剂和复合微生物菌剂
农用微生物菌剂国家标准：（GB20287-2006）
复合菌剂：每一种有效菌的数量不得少于0.01亿/g（mL）；以单一的胶质芽胞杆菌制成的粉剂产品中有效活菌数不少于1.2亿/g。 土壤中施入微生物菌对于改良土壤、提升地力、改善土壤生态环境、提高农作物产量和品质具有极其重要的作用。桂林微生物菌剂阶格
进入九月份，不少蔬菜作物已经准备移栽定植或刚定植完，在这一阶段作物需要促生新根，快速度过缓苗期。如果作物在苗期生根少、发棵慢、成活率低，会导致中期作物长势变弱，后期也更容易出现早衰、产量降低等情况。追本溯源，这些情况大多都是和根系有关。根是作物健康生长的关键，根不好了，作物很难健康生长，作物根系问题不容忽视。因此，很多**建议，在定植前后施用合适的微生物菌剂来帮助作物更好地生根护根、预防死苗烂根、提高幼苗成活率。云南质量微生物菌剂有效菌可以分解土壤中的有机质，并且生成腐殖酸可与土壤中的氮形成腐殖酸铵，减少氮肥流失。
在国内市场上流通的微生物菌剂有国内厂家自己研发生产的，也有代理国外的菌剂产品，比较多的是美国、日本、韩国、澳大利亚、荷兰等。与国外相比，国内微生物菌剂可能在深度研究方面尚有欠缺，在产品稳定性上也有不足，但是不得不承认，相对于国外，微生物菌剂在中国的市场是相当可观的。
国内的农业种植在不断变化升级，土地流转进行时，种植大户越来越多，他们的思维在变化，但就农化产品的选择就由价格主导转向为效益主导，这种价值观念潜移默化中影响着周边的散户。
保质期内产品质量变化大等，导致应用效果的不稳定。
菌剂生产日期是下半年的话，厂家工艺不合格，很多液体包装或者桶装很多产品会出现胀气，胀气是因为微生物是***，在发酵时是在桶里面添加适宜微生物生长的有机质，完成自身定殖，数量成基数的增长，出灌包装成成品，发到市场上一定要使微生物处于休眠状态。休眠状态时间长短，一方面与营养物质浓度有关，另外还跟接触的外界温度，菌剂抗逆活性有很大关系，国外比较好的成品，有效期能达到5年左右，国内一般在两到三年。
大量的镉、砷、铬、铅等重金属沉积在土壤中，导致土壤受到严重污染。
众所周知，我国的农业复种**高，两年三熟，一年两熟，有些地区甚至一年三熟。这么高的复种**，土地早已经不堪重负！很多人发现，现在即使使用再多的化肥和农药，土地作物产量也没有明显提升。
**度、复种**高都是中国农业种植的特点，从之前的不使用化肥农药的低产出到依赖大量化肥农药带来高收入，中国的农业一直以来都处于过度开发土地生产潜力的误区。
我国的农业种植大量的使用化肥农药，尤其是大棚蔬菜，以及果树区，农药化肥的投入占据整个生产成本的三分之二。不仅使用量大，化肥利用率也低，不到30%，所以现在我们要承受放肆依赖化肥农药的后果。
作物长不好的原因是作物的根不好，作物的根不好是因为土不好，土不好是因为土壤里缺乏大量的有益微生物菌。桂林微生物菌剂阶格
施用微生物菌剂前，菜农可通过提前浇小水、控制好温湿度等措施，为微生物菌创造适宜的生存环境，保证肥效。桂林微生物菌剂阶格
微生菌剂为**的微生物肥料被列入国家“十三五”生物产业发展重点产品。在国家宏观层面“***减药”、“化肥零增长”、“农业可持续发展”和“生态农业”等国家需求，离不开微生物肥料产业的发展，所以说市场发展前景看好。但微生物菌剂产品田间效果稳定性需要提高，由于土壤环境的复杂，微生物菌剂在根际的存活与竞争定植规律以及与植物根系分泌物互作过程等还需要进一步研究，微生物菌剂产品实际应用过程中会出现这样那样的问题，甚至给农业生产造成损失。
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