另一方面要增加有益微生物的种类和数量，也就是施用一定数量的菌肥。菌肥也称生物肥料、细菌肥料。确切地说，它们是菌而不是肥，主要成分不是营养元素，而是大量的微生物。它的功效在于通过微生物的活动，改善作物的营养条件并分解土壤中的有机质，使他们变成能够被植物吸收的营养，这就如同人吃的饭菜必须经过消化才能被吸收一样。秸秆还田后如果没有微生物的帮助，不仅不能被植物利用，还可能助长病菌的滋生；另一方面，再好、再多的菌肥撒在贫瘠的土壤中也不可能凭空转换出营养元素，有益微生物也会饿死。只有当有机物与有益微生物同时存在时，才能起到增肥防病的效果。一种按适当比例在大量有机物质中植入有益微生物的生物菌肥，其生物菌肥包括能够增加或转化营养的固氮菌、硝酸菌、溶磷菌、光合菌；能够分解有机质的酵母菌；能够分泌植物生长刺刺激药素和压制病菌的哈刺木霉、绿粘帚霉、放线菌以及一些芽胞杆菌和假单胞菌。生物菌肥种具有长效、快速见效、增产防病的优点，值得推广。它的优劣主要看植入的有益微生物种类和数量。在这里也提醒大家注意，生物菌肥和多效有机肥不宜长时间存放，要避免高温，一般也不能和杀菌剂混用“这是俺自制的生物菌肥,用了它之后。国内外多年试验证明，用根瘤菌接种大豆、花生等豆科作物可提高共生固氮效能.青海常规生物菌肥技术指导
数量不能说明全部，不但要看菌数量(菌肥粉剂类有效活菌数不低于2亿/克)，还要看有效活菌的数量，使用后起作用的只有活菌，有益活菌数量越大效果会表现越好。三、功能菌种齐全经多年研究微生物菌肥发现复合无拮种施入土壤中所发挥的效果的比单一菌种，效果相对要好。四、所选用的菌在土壤中的定植能力要强生产厂家要有强大的技术研发背景，筛选出抗逆性强，适应环境的能力强、抗性稳定不反复的菌种（如枯草芽孢杆菌、绿色木霉、淡紫拟青霉等）。上海常规生物菌肥咨询报价生物菌肥采用了先进的微生物技术，通过选育和培养特定的菌种，将有益微生物引入土壤中。
与化肥混用要注意化肥用量不能过大。高浓度的化学物质对菌肥里的微生物0害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。***，注意千万不要与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫化肥，如***钾等以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。在施用时，若施菌肥与防病虫、除草相矛盾时，可先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。同时还应防止与未腐熟的农家肥混用，因为农家肥在腐熟的过程中会发酵，这样会直接杀死生物菌。
1、多年的试验示范结果表明，多粘类芽孢杆菌具有两大功能:(1)通过灌根可有效防治植物细菌性和土传病害，同时可使植物叶部的细菌害明显减少;(2)对植物具有明显的促生长、增产作用。2、多粘类芽孢杆菌对细菌性土传病害――植物青枯病具有很好的防治效果，在收获后期，对番茄、茄子、辣椒、马铃薯、罗汉果和生姜青枯病(姜瘟病)的田间防效可达70~92%，增产率可达493%，甚至当对照发病率高达97%时防效也是如此。3、多粘类芽孢杆菌对土传病害――植物枯萎病也具有很好的防治效果，在收获后期，对番茄、茄子、辣椒、西瓜、甜瓜、黄瓜、苦瓜、冬瓜、香蕉和草莓等枯萎病的田间防效可达65~85%。4、多粘类芽孢杆菌对芋头软腐病、大白菜软腐病、辣椒根腐病、花卉根腐病、玉竹根腐病、沙参根腐病、番茄猝倒病、番茄立枯病以及辣椒疫病等土传病害也具有较好的防治作用。5、此外，多粘类芽孢杆菌对植物具有明显的促生长作用，可使田间植株高度比空白对照区增加10-30cm;甚至在植物不发青枯病时，也可使植物的产量增加27.5%，且增产主要表现为收获前期。我们致力于为广大农业生产者提供高质量的产品和服务，共同推动农业可持续发展。
与化肥混用，化肥用量过大高浓度的化学物质对菌肥里的微生物有毒害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。没有因量制宜对于多年来用化肥的田块施用了生物菌肥不能大量减施化肥和有机肥，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子适应，因此，其取代理应做到***、二、三年分别取代30%、40%和60%。磷、钾肥只能补足，不能减少。没有因时制宜生物菌肥不是***肥，所以，要在作物的营养临界期和大量吸收期前7～10天施用效果比较好。我们常说，没有有机质，就没有肥沃的土壤。有机质对农作物是极其重要的，是农作物的重要营养来源。上海湿地生物菌肥品质保障
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根际环境保护屏障：菌群中的地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤后，迅速繁殖成为优势菌群，控制根际营养和资源，使重茬、根腐、立枯、流胶、灰霉等病原菌丧失生存空间和条件。使植物根系细胞的细胞壁增厚，纤维化、木质化，并生成角质双硅层，形成阻止病原菌侵袭的坚固屏障。增强抗逆性：菌肥中的微生物在植物根部大量生长、繁殖，从而形成优势菌群，优势菌群形成局部优势，这样就能***和减少病原菌的入侵和繁殖机会，起到了减轻作物病害的功效。菌群中的地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌等有益微生物可增强土壤缓冲能力，保水保湿，增强作物抗旱、抗寒、抗涝能力；同时侧孢芽孢杆菌还可强化叶片保护膜，抵抗病原菌侵染，抗病，抗虫。青海常规生物菌肥技术指导
