采集原始菌群比较好在当地林木茂密的山上选点，树木越多，生长年头越长，其林下积累的枯枝落叶就越多，这些枯枝落叶在各种生物菌的作用下形成厚厚的一层落叶土，这种落叶土就富含各种土著菌。采集时间比较好在早春进行，早春的温度较低，有利于发酵用酵母菌的繁殖，而不利于细菌、放线菌等的繁殖。米饭是微生物的喜欢，用电饭煲蒸一锅米饭；等米饭凉后松散开，并埋入林下的落叶土中；大概10天左右米饭中就会出现大量白色的菌丝(温度高时时间会短些)；这样米饭团就变成了富含各种土著菌，特别是酵母菌的原始菌群了(图1)。其实在林下收集有白色菌丝的树皮、落叶也可用来直接制作菌剂。方便的地方直接用落叶土(10%的比例)和堆肥原料一起堆肥也可以。a.将米饭埋入落叶土中。b.取出富集原始菌的饭团。c.收集到的原始菌群。d.将原始菌群和麦麸一起发酵。e.及时翻倒。f.将阴干的菌肥装袋放置：菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。山东生物菌肥品质保障
通过上表我们看到，有机物料腐熟剂同为执行《农用微生物菌剂GB20287-2006》的生物菌类产品，此类产品容易与农用微生物菌（肥）剂类产品混淆，注意要分清。此类产品的主要技术指标是：有效活菌数(cfu)含量为亿个/g或mL，粉剂和颗粒都要求≥0.5亿个/g，而液体要求≥1.0个/mL）；纤维素酶活（以农作物秸秆类为腐熟对象测定纤维素酶活），U/g（mL）≥30U，蛋白酶活（以畜禽粪便类为腐熟对象测定蛋白酶活），U/g（mL）≥15U。农用微生物菌剂和有机物料腐熟剂的保质期均为6个月（液体剂型的为≥3个月。河北常规生物菌肥价格实惠刺激有机质释放营养。丰富的有机质通过微生物活动后可释放出植物生长所需的营养元素，达到肥效持久的目的。
没有根据田间实际状况对含硫高的土壤和锈水田，不宜施用生物菌肥，因为硫能杀死生物菌。没有根据土壤墒情施用菌肥的比较好温度是25℃～27℃，低于5℃、高于45℃，施用效果较差。同时还应掌握固氮菌适宜的土壤湿度为60%左右，即见干见湿的土壤湿度**为适宜。和其他农药混用，降低活性为防止活菌致死注意千万不要与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫化肥，如硫酸钾等以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。在施用时，若施菌肥与防病虫、除草相矛盾时，可先施菌肥，隔48小时后再打药除草；若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。同时还应防止与未腐熟的农家肥混用，因为农家肥在腐熟的过程中会发酵，这样会直接杀死生物菌。
生物菌肥根据其作用不同，又可分为5类：有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮蓝藻等；分解土壤有机物的菌肥：包括有机磷细菌和复合细菌等；分解土壤中难溶性矿物的菌肥：包括硅酸盐细菌、无机磷细菌等；促进作物对土壤养分利用的菌肥：包括菌根菌等；抗病及刺激作物生长的菌肥：包括抗生菌、增产菌等。丰富的有机质还可以改良土壤物理性状，改善土壤团粒结构，从而使土壤疏松，减少土壤板结，有利于保水、保肥、通气和促进根系发育，为农作物提供适合的微生态生长环境。菌剂是农用微生物菌剂的简称，对应的标准是《农用微生物菌剂》。
我们在使用这类生物菌之前，必须要先将其放在水分充足的环境中静置30~60分钟。不管是喷施用的还是土埋用的，使用之前都必须经过这样的处理。其次，***后的孢子，其寿命只有一个月左右的时间。有果农说，它不是可以繁殖的吗？非也，只有未经过改良的活菌才能繁殖，而经过改造的孢子是不具备这个功能的，哪怕是孵化之后的孢子也没有。也就是说，我们用这种生物菌的时候，本来有多少孢子，用到田里时多也就只有这么多活菌，往后活菌只会越来越少，不会增多。那么包装袋上显示的是“XX亿活菌”字样的生物菌呢？毋庸置疑，它是完全具备增殖能力的。这么说来，岂不是我们把这类生物菌施下去以后，它就可以持续繁殖下去发挥作用了？小心别被厂家的宣传蒙骗了！活菌具有增殖能力不假，但他们没有告诉你的是，它还会退化。其实一般的生物菌持效期都是在90天左右。因为驯化后的活菌多只能保持2~3代的现有性状繁殖，3代以后就会出现退化。那个时候，它也就不再具备厂家宣传上所说的功效了。因此，在植物根际施用微生物肥料，就可以增加根际土壤中的有益菌的数量和活性，导致土壤肥力的增强。贵州生物菌肥阶格
市场上出现的各种生物肥料，实际上是含有大量微生物的培养物。它们可以是粉剂或颗粒，也可以是液体状态。山东生物菌肥品质保障
温度在微生物肥料中的作用这里就主要说温度与生物菌活性的影响。首先就结论上来说：生物菌的活性会随着温度降低而降低，但是生物菌不会被冻死，只会休眠。但不是说活性会随着温度降低而降低吗？怎么当前还更适合施用菌肥呢？别急，之所以有这些疑惑，是因为混淆了气温与地温的关系。1、气温我们平常所说的温度，无论是天气热了，还是天气凉了，其实一般都是指的是气温。而气温的测量是在离地1.5米，避免阳光直射、通风的草坪上，这样能更真实体现大气的温度状况。但是我们的菌肥是用在土壤当中的，所以气温的变化不能用来作为衡量生物菌活性的标准，为此我们需要的是地温的衡量。山东生物菌肥品质保障
